The role of alternative splicing in plants

• Název práce v češtině: Úloha alternativního sestřihu u rostlin
• Název v anglickém jazyce: The role of alternative splicing in plants
• Klíčová slova: alternativní sestřih, reakce na stres, sekvenování RNA, rostliny, diverzita proteomu
• Klíčová slova anglicky: alternative splicing, stress response, RNA sequencing, plants, proteome diversity
• Akademický rok vypsání: 2021/2022
• Typ práce: bakalářská práce
• Jazyk práce: angličtina
• Ústav: Katedra experimentální biologie rostlin (31-130)
• Vedoucí / školitel: Mgr. Božena Klodová, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd.
• Datum přihlášení: 09.11.2021
• Datum zadání: 10.11.2021
• Datum potvrzení stud. oddělením: 10.11.2021
• Datum odevzdání elektronické podoby: 11.12.2023
• Datum proběhlé obhajoby: 22.01.2024
• Oponenti: RNDr. Lukáš Fischer, Ph.D.
• Konzultanti: prof. RNDr. David Honys, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Alternativní sestřih je běžný mechanismus regulace genové exprese u rostlin vedoucí ke zvyšování komplexity transktiptomu i proteomu jedince. Vznik isoformních variant a jejich následná translace vede k sub-funcionalizaci proteinů a je proto často důležitá v mnohých vývojových a adaptačních procesech. Tato práce si klade za cíl shrnout mechanismy a důsledky alternativního sestřihu ve vývoji rostlin a popsat metodologické postupy umožňující jeho studium.