Na základě fosfoproteomové studie jsme zjistili, že Ser/Thr proteinkináza StkP fosforyluje za podmínek stresu buněčné stěny sigma faktor SigA. SigA je hlavním sigma faktorem S. pneumoniae a zodpovídá za expresi housekeeping genů. Cílem práce bude potvrdit fosforylaci SigA in vitro a in vivo. Pokud se podaří prokázat specifickou fosforylaci SigA, bude dalším cílem charakterizovat vliv fosforylace na fci SigA a jeho interakci s RNAP. StkP vykazuje specifickou lokalizaci v buněčném septu. Dalším cílem práce bude připravit kmen exprimující StkP fúzovanou s fluorescenčním proteinem v nativním lokusu a sledovat lokalizaci StkP za stresových podmínek.
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce
Based on a phosphoproteome study, we found that the Ser / Thr protein kinase StkP phosphorylates sigma factor SigA under cell wall stress conditions. SigA is the major sigma factor of S. pneumoniae and is responsible for the expression of housekeeping genes. The aim of this work will be to confirm the phosphorylation of SigA in vitro and in vivo. If specific phosphorylation of SigA can be demonstrated, another goal is to characterize the effect of phosphorylation on the function of SigA and its interaction with RNAP. StkP shows specific localization in cell division septa. Another goal of this work is to construct strains expressing StkP tagged to fluorescent protein in the native locus and to study the localization of StkP under stress conditions.
- zadáno a potvrzeno stud. odd.