Samostatná rešerže k zadanému tématu z veřejně dostupných informací v českém a anglickém jazyce, sepsání práce, včetně věcné závěrečné diskuse. Rozsah práce 50-60 stran dle zadání, počet citací předběžně 20-30.
Seznam odborné literatury
Wan, L., Zhu, Y., Zhang, W., Mu, W., 2020. α-L-Fucosidases and their applications for the production of fucosylated human milk oligosaccharides. Appl. Microbiol. Biotechnol. 104, 5619–5631. Zeuner, B., Muschiol, J., Holck, J., Lezyk, M., Gedde, M.R., Jers, C., Mikkelsen, J.D., Meyer, A.S., 2018. Substrate specificity and transfucosylation activity of GH29 α-L-fucosidases for enzymatic production of human milk oligosaccharides. New Biotechnol. 41, 34–45. Zeuner, B., Vuillemin, M., Holck, J., Muschiol, J., Meyer, A.S., 2018b. Loop engineering of an α-1,3/4-L-fucosidase for improved synthesis of human milk oligosaccharides. Enzym. Microb. Technol. 115, 37–44. Osanjo, G., Dion, M., Drone, J., Solleux, C., Tran, V., Rabiller, C., Tellier, C., 2007. Directed evolution of the α-L-fucosidase from Thermotoga maritima into an α-L- transfucosidase. Biochemistry 46, 1022–1033.
Předběžná náplň práce
Prozkoumání knihovny vláknitých hub a nalezení zástupců vykazujících α-L-fukosidasovou aktivitu vůči pNP-α-L-fukosidu. Exprese, purifikace a charakterizace rekombinantní varianty alespoň jedné α-L-fukosidasy (komerční plasmid s příslušným genem bude navržen ve spolupráci s konzultantem na školicím pracovišti). Analýza regioselektivity a syntetického potenciálu připraveného rekombinantního enzymu. Syntéza fukosylovaných oligosacharidů.
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce
Screening of the library of filamentous fungi and identification of representatives showing α-L-fucosidase activity with pNP-α-L-fucoside substrate. Expression, purification and characterization of a recombinant variant of at least one new α-L-fucosidase (commercial plasmid with the corresponding gene will be designed in collaboration with the supervisor at the training facility). Analysis of regioselectivity and synthetic potential of the prepared recombinant enzyme. Synthesis of fucosylated oligosaccharides
