Projekt se týká možné role adhezních receptorů spřažených s G proteinem během virové infekce savčích buněk. aGPCR jsou velmi zajímavou třídou proteinů obsahujících 7 transmembránových domén, které hrají důležitou roli při vývoji nervového systému, v imunitní odpovědi a v rakovině, avšak jejich role během virové infekce je zvětší části neprozkoumaná. V současnosti rozpoznáváme 33 členů skupiny aGPCR u lidí, ale většina patří mezi sirotčí receptory s neznámou funkcí. Chystáme se hledat specifické aGPCR a/nebo buněčné proteiny v aGPCR drahách a charakterizovat jejich interakci s virovými proteiny. Během postgraduálního studia se student naučí pracovat s tkáňovými kulturami v laboratoři s úrovní technického zabezpečení 3, provádět proteomické a bioinformační analýzy, siRNA experimenty snižující genové exprese v savčích buňkách infikovaných různými viry. Navržený projekt rozšíří naše současné vědění o roli aGPCR během infekce savčích buněk a v případě úspěchu pomůže identifikovat potenciální cíle antivirové terapie.
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce
Project addresses the possible role of adhesion G protein-coupled receptors (aGPCRs) during viral infection of mammalian cells. The aGPCRs are intriguing class of seven-transmembrane proteins that play important role in neurodevelopment, immune defense and cancer, but their role during viral infection is mostly unexplored. Currently, we recognize 33 members of aGPCRs in humans but majority are orphan receptors with unknown function. We intend to search for specific aGPCR and/or cellular proteins in aGPCRs pathways involved in infections of mammalian cells and characterize their interaction with viral proteins. During postgradual study, student will learn how to work with cell cultures in biosafety level 3, perform proteomic and bioinformatic analyses and siRNA experiments for gene-knockdown in mammalian cells infected with various viruses. Proposed project will broaden our current knowledge about the role of aGPCRs in infections of mammalian cells and if successful, it can identify potential targets for antiviral therapy.
- zadáno a potvrzeno stud. odd.