Cílem projektu je vytvořit novou verzi webového pluginu MolArt. Tento nástroj integruje dvě vizualizační komponenty. První zobrazuje proteinové sekvence a jejich anotace, přičemž druhá zajišťuje vykreslení 3D struktury proteinu. Propojení těchto komponent umožňuje generování hypotéz, které by bylo obtížné zvlášť ze znalosti sekvence nebo struktury. V rámci projektu budou využity novější verze obou vizualizačních komponent a budou poskytnuty pokročilejší funkce k analýze struktur, např. vícenásobné zvýraznění pozic sekvence proteinu. Rozhraní pluginu bude navrženo tak, aby bylo snadné nahradit 3D vizualizační komponentu. Nová verze nástroje bude implementována v jazyce TypeScript, což zajistí lepší udržitelnost a zjednoduší následný vývoj.
Seznam odborné literatury
[1] Hoksza, David, et al. "MolArt: a molecular structure annotation and visualization tool." Bioinformatics 34.23 (2018): 4127-4128.
[2] Rozentals, Nathan. Mastering TypeScript. Packt Publishing Ltd, 2017.
[3] Purewal, Semmy. Learning Web App Development: Build Quickly with Proven JavaScript Techniques. " O'Reilly Media, Inc.", 2014.
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce
The goal of the project is to develop a new version of the MolArt web-based plugin. This tool integrates components for visualization of protein sequence and its annotations and corresponding protein structure. These components are interlinked and enable the generation of hypotheses that would otherwise be difficult. The new version of the plugin will utilize new visualization components and will enable advanced structure analysis such as multiple position highlighting. The new version will be implemented in TypeScript enabling improving further maintenance and development.
