Phytophthora alni subsp. alni je invazní patogen napadající olše, doposud známý z Evropy (včetně ČR). Jedná se o triploidní a zároveň nejvýznamnější taxon širšího hybridního komplexu Phytophthora alni sensu lato. V současné době se tento invazní taxon šíří postupně Evropou a působí značné environmentální i ekonomické škody. Populace taxonu se stále vyvíjí a byla zachycena celá řada nových genetických linií. Cílem práce je objasnit vývoj genetické struktury populace invazního patogenu Phytophthora alni subsp. alni v průběhu invaze. V průběhu práce bude porovnána populační struktura lokálních populací na čele postupu fronty epidemie (disease front) a v oblasti v postepidemické fázi vývoje, a to s pomocí analýzy již existujícího sbírkového materiálu (sbíraného kolem r. 2010 na čele fronty) a nově provedených reizolací v téže oblasti (dnes se nachází v postepidemické fázi vývoje). Nejprve bude ve spolupráci s Výzkumným ústavem pro krajinu a okrasné zahradnictví (VÚKOZ), v.v.i. provedena izolace dostatečného množství materiálu (40-50 izolátů) z každé z vybraných oblastí – západních Čech (materiál sbíraný VÚKOZ, v.v.i. kolem r. 2010 je k dispozici) a Slezska. V další fázi budou izolované kmeny genotypovány pomocí analýzy mikrosatelitů (soubor 10 mikrosatelitů, které jsou již známy) a identifikovány multilokusové genotypy. Na základě zjištěné diverzity těchto genotypů a jejích podílů zastoupení v obou oblastech a časových obdobích pak budou určeny rozdíly v populační struktuře a popsán předpokládaný vývoj taxonu.
- zadáno a potvrzeno stud. odd.