Porovnání různých molekulárně-biologických přístupů pro detekci přítomnosti DNA patogenní bakterie Haemophilus influenzae

• Název práce v češtině: Porovnání různých molekulárně-biologických přístupů pro detekci přítomnosti DNA patogenní bakterie Haemophilus influenzae
• Název v anglickém jazyce: Comparison of different molecular-biological approaches for detecting the presence of DNA of the pathogenic bacterium Haemophilus influenzae
• Klíčová slova: Haemophilus influenzae, polymerázová řetězová reakce (PCR), izotermální amplifikace DNA pomocí smyček (LAMP)
• Klíčová slova anglicky: Haemophilus influenzae, polymerase chain reaction (PCR), isothermal loop mediated DNA amplification (LAMP)
• Akademický rok vypsání: 2020/2021
• Typ práce: bakalářská práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra biochemie (31-250)
• Vedoucí / školitel: prof. RNDr. Markéta Martínková, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem, čeká na schválení garantem
• Datum přihlášení: 14.11.2020
• Datum zadání: 16.11.2020
• Datum odevzdání elektronické podoby: 16.06.2021
• Datum proběhlé obhajoby: 28.07.2021
• Oponenti: RNDr. Helena Dračínská, Ph.D.
• Konzultanti: Mgr. Petr Jeřábek, Ph.D.

Zásady pro vypracování

Doporučené povinně-volitelné předměty
MC250P07B Internet a bioinformatika
nebo
MC200P02 Základy metod charakterizace chemických látek

Doporučené volitelné předměty
MC250P21 Moderní metody výzkumu proteinů
MC250P30 Bioinformatika

Seznam odborné literatury

Notomi, T., Okayama, H., Masubuchi, H., Yonekawa, T., Watanabe, K., Amino, N., and Hase, T. (2000) Loop-mediated isothermal amplification of DNA. Nucleic Acids Res. 28, E63
Mori, Y., Nagamine, K., Tomita, N., and Notomi, T. (2001) Detection of loop-mediated isothermal amplification reaction by turbidity derived from magnesium pyrophosphate formation. Biochem. Biophys. Res. Commun. 289, 150–154
Tomita, N., Mori, Y., Kanda, H., and Notomi, T. (2008) Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) of gene sequences and simple visual detection of products. Nat Protoc. 3, 877–882

Předběžná náplň práce

Součástí bakalářské práce bude vyhledání dosavadních poznatků o možnostech amplifikace daného úseku DNA v odborné literatuře. Budou porovnány různé molekulárně biologické přístupy detekce genu glpQ bakterie Haemophilus influenzae. Konkrétně se zaměříme hlavně na výhody a nevýhody polymerázové řetězové reakce (z angl. polymerase chain reaction, PCR) a izotermální amplifikace pomocí smyček (z angl. isothermal loop mediated amplification, LAMP).