Ribozomální protein Rpl22 je v kvasince Saccharomyces cerevisiae exprimován ze dvou paralogních genů, RPL22A a RPL22B. Tyto geny obsahují intron a jejich transkripty tedy podléhají sestřihu. U obou paralogů je umožněna regulace sestřihu vlastním proteinem Rpl22. Protein Rpl22 se váže do oblasti intronu nesestřiženého transkriptu a inhibuje průběh rané fáze jeho sestřihu. Diplomová práce má za cíl zkoumat inhibiční působení vazby proteinu Rpl22 na sestřih transkriptu RPL22B na úrovni sestavování spliceosomu. Pro výzkum bude využita metoda ChIP, pomocí níž bude nepřímo sledována kotranskripční vazba spliceozomálních podjednotek k nesestřiženému transkriptu RPL22B. Získaná data budou porovnávána mezi kmeny se zvýšenou a sníženou inhibicí sestřihu RPL22B. Předmětem práce bude, na základě výsledků analýzy ChIP a jejich srovnání, definovat, zdali je sestřih zasažen již během sestavování spliceosomu a případně jaké změny v jeho sestavování s inhibicí sestřihu transkriptu RPL22B souvisí.
- zadáno a potvrzeno stud. odd.