Polyomavirové minichromozomy: interakce se složkami vrozené imunity
| Název práce v češtině: | Polyomavirové minichromozomy: interakce se složkami vrozené imunity |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce: | Polyomavirus minichromosomes: interactions with components of innate imunity |
| Klíčová slova: | myší polyomavirus; vrozená imunita; histon H3.3; DAXX; ATRX; PML; cGAS |
| Klíčová slova anglicky: | mouse polyomavirus; innate immunity; histone H3.3; DAXX; ATRX; PML; cGAS |
| Akademický rok vypsání: | 2020/2021 |
| Typ práce: | diplomová práce |
| Jazyk práce: | čeština |
| Ústav: | Katedra genetiky a mikrobiologie (31-140) |
| Vedoucí / školitel: | doc. RNDr. Jitka Forstová, CSc. |
| Řešitel: | skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd. |
| Datum přihlášení: | 09.11.2020 |
| Datum zadání: | 02.01.2021 |
| Datum potvrzení stud. oddělením: | 02.01.2021 |
| Datum odevzdání elektronické podoby: | 25.04.2023 |
| Datum proběhlé obhajoby: | 30.05.2023 |
| Oponenti: | Mgr. Kateřina Trejbalová, Ph.D. |
| Ocenění: | Práce byla navržena na ocenění |
| Předběžná náplň práce |
| Histon H3.3 se liší od histonů H3.1, H3,2 pouze několika aminokyselinami ale liší se, mimo jiné, způsobem inkorporace do chromatinu i regulací exprese jeho genu. Distribuce H3.3 v savčích genomech je nerovnoměrná. Do chromatinu je inkorporován různými komplexy remodulujícími chromatin (ATRX, CHD1) a chaperonovým komplexem HIRA. Role H3.3 v různých biologických procesech je v současnosti studována. V předběžném pokusu byla zjištěna jeho přítomnost na minichromosomech MPyV. Práce bude zahrnovat experimenty vedoucí ke zjištění, zda-li a jaké histonové chaperony jsou lokalizovány na minichromosomu myšího polyomaviru (MPyV), dále, je-li ovlivněna exprese histonových chaperonů infekcí myším polyomavirem a případně také jaké histonové chaperony se podílejí na kumulaci histonu H3.3 na minichromosomech MPyV. Hlavní metody: Reakce qRT-PCR bude použita ke srovnání exprese genů pro histonové chaperony v infikovaných a neinfikovaných buňkách Konfokální mikroskopií bude určována přítomnosti histonových chaperonů na minichromosomech MPyV Role histonových chaperonů v umístění H3.3 na MPyV minichromosomech bude zjišťována s použitím buněk neprodukujících některý z histonových chaperonů („knockout cells“ nebo „knockdown“ pomocí příslušných si RNA) |