Hypotetický protein Spr1962 jako nový substrát signalizační dráhy Ser/Thr proteinkinázy StkP a fosfatázy PhpP.

• Název práce v češtině: Hypotetický protein Spr1962 jako nový substrát signalizační dráhy Ser/Thr proteinkinázy StkP a fosfatázy PhpP.
• Název v anglickém jazyce: Hypothetical protein Spr1962 as a new substrate of the signalling pathway of the Ser/Thr protein kinase StkP and phosphatase PhpP.
• Klíčová slova: Streptococcus pneumoniae, proteinkináza StkP, fosforylace, protein Spr1962, fosfatáza PhpP, flotilin, funkční membránové mikrodomény
• Klíčová slova anglicky: Streptococcus pneumoniae, StkP protein kinase, phosphorylation, Spr1962 protein, PhpP phosphatase, flotillin, functional membrane microdomains
• Akademický rok vypsání: 2020/2021
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra genetiky a mikrobiologie (31-140)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Aleš Ulrych, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd.
• Datum přihlášení: 06.11.2020
• Datum zadání: 06.11.2020
• Datum potvrzení stud. oddělením: 06.11.2020
• Datum odevzdání elektronické podoby: 26.04.2023
• Datum proběhlé obhajoby: 01.06.2023
• Oponenti: doc. RNDr. Radovan Fišer, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Streptococcus pneumoniae jako extracelulární lidský patogen kódující jedinou serin/threoninovou (Ser/Thr) proteinkinázu eukaryotního typu (StkP) a příslušnou PP2C fosfatázu (PhpP) je výborným modelem pro studium tohoto typu signalizačních drah u bakterií. Přestože u pneumokoka bylo dosud identifikováno pouze několik substrátů těchto signalizačních proteinů, dá se vzhledem k pleiotropnímu účinku na různé buněčné procesy, včetně buněčného dělení a syntézy peptidoglykanu, předpokládat existenci široké regulační dráhy řízené párem StkP/PhpP.
Pomocí globální fosfoproteomové studie založené na MS analýze se nám nedávno podařilo identifikovat celou řadu potenciálních substrátů této signalizační dráhy. Jedním z identifikovaných proteinů je hypotetický protein Spr1962 jehož fosforylace byla detekována pouze v hyperfosforylovaném kmeni s odstraněnou fosfatázou PhpP. Cílem této diplomové práce bude charakterizovat protein Spr1962; především potvrdit místo fosforylace závislé na StkP/PhpP fosforylačním páru a pokusit se objasnit funkci Spr1962.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

Streptococcus pneumoniae as an extracellular human pathogen encoding a single serine/threonine (Ser/Thr) protein kinase of the eukaryotic type (StkP) and the corresponding PP2C phosphatase (PhpP) is an excellent model for studying this type of signalling pathways in bacteria. Although only a few substrates of these signalling proteins have been identified in pneumococcus to date, due to the pleiotropic effect on different cellular processes, including cell division and peptidoglycan synthesis, the existence of a broad regulatory pathway controlled by the StkP/PhpP pair can be expected.
Using a global phosphoproteomic study based on MS analysis, we have recently identified a number of potential substrates of this signalling pathway. One of the identified proteins is the hypothetical protein Spr1962, the phosphorylation of which was detected only in a hyperphosphorylated strain with deleted PhpP phosphatase. The aim of this diploma thesis will be to characterize the Spr1962 protein; in particular, to confirm the phosphosite dependent on the StkP/PhpP phosphorylation pair and to elucidate the function of Spr1962.