Molecular mechanisms of Bardet-Biedl Syndrome
| Název práce v češtině: | Molekulární mechanizmy Bardet-Biedlova syndromu |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce: | Molecular mechanisms of Bardet-Biedl Syndrome |
| Klíčová slova: | Bardet-Biedlův syndrom, ciliopatie, cilie, BBSome, BBS1, transport proteinů, BBS1-R160Q, BBS1-E224K, BBS1-M390R |
| Klíčová slova anglicky: | Bardet-Biedl Syndrome, ciliopathy, cilia, BBSome, BBS1, protein transport, BBS1-R160Q, BBS1-E224K, BBS1-M390R |
| Akademický rok vypsání: | 2022/2023 |
| Typ práce: | diplomová práce |
| Jazyk práce: | angličtina |
| Ústav: | Katedra buněčné biologie (31-151) |
| Vedoucí / školitel: | Mgr. Martina Huranová, Ph.D. |
| Řešitel: | skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd. |
| Datum přihlášení: | 10.10.2022 |
| Datum zadání: | 10.10.2022 |
| Datum potvrzení stud. oddělením: | 06.02.2023 |
| Datum odevzdání elektronické podoby: | 28.04.2024 |
| Datum proběhlé obhajoby: | 03.06.2024 |
| Oponenti: | Mgr. Lenka Doubravská, Ph.D. |
| Seznam odborné literatury |
| 1. Niederlova V, Modrak M, Tsyklauri O,Huranova M*, Stepanek O*: Meta-analysis of genotype-phenotype associations in Bardet-Biedl Syndrome uncovers differences among causative genes. Hum Mutat. 2019 Nov;40(11):2068-2087. 2. Prasai A, Schmidt Cernohorska M, Ruppova K, Niederlova V, Andelova M, Draber P, Stepanek O*,Huranova M*:The BBSome assembly is spatially controlled by BBS1 and BBS4 in human cells. J Biol Chem. In press. 3. Tsyklauri O, Niederlova V, Forsythe E, Drobek A, Prasai A, Sparks K, Trachtulec Z, Beales PL,Huranova M*, Stepanek O*: Altered hematopoietic system and self-tolerance in Bardet-Biedl Syndrome. BioRxiv, doi: 2020.02.24.962886 |
| Předběžná náplň práce |
| Bardet-Biedlův syndrom (BBS) je vzácné dědičné onemocnění ze skupiny ciliopatií, tedy syndromů způsobených dysfunkcí primárních cilií. Primární cilie jsou buněčné organely, které fungují jako "buněčné antény" tím, že reagují na extracelulární stimuly spuštěním příslušných signálních drah. V naší laboratoři studujeme primární cilie a proteinový komplex BBSome, který se účastní transportu proteinů do a z cilie. BBS1 je podjednotka, jejíž mutace je častou příčinou vzniku BBS. Celkem bylo identifikováno 24 takových mutací v lidské populaci. Cíl tohoto projektu je identifikovat molekulární principy, které vedou k tomu, že tyto mutace vytvářejí defektní BBSome. Student bude charakterizovat pathogenní varianty BBS1 v našich etablovaných modelových liniích. Tato analýza bude obsahovat fluorescenční mikroskopické techniky a metody molekulární biologie. Relevantní publikace naše laboratoře k vypsanému tématu jsou uvedeny v seznamu odborné literatury. |
| Předběžná náplň práce v anglickém jazyce |
| Bardet-Biedl Syndrome (BBS) is a rare hereditary disease belonging to a group of ciliopathies, i.e., syndromes caused by a dysfunction of primary cilia. Primary cilia are specialized cellular organelles that function as cellular antennae by perceiving extracellular stimuli and transducing them through a multitude of signalling cascades. In our laboratory, we study the primary cilia and the BBSome complex, which facilitates transport of various signaling receptors into and out of the cilium. The BBS1 subunit is mutated most frequently and currently 24 BBS-causative mutations in BBS1 were identified in human patients. The aim of this project is the identification of the pathology of the individual human mutations on the molecular and cellular level.The student will characterize the pathogenic BBS1 variants in our established cell line models. The analysis will include fluorescence microscopy techniques and methods of molecular biology. Publications of our laboratory relevant to the diploma thesis are listed above. |