Analýza lokalizace endomembránových markerů v kortikální vrstvě rostlinných buněk a jejich interakce s komplexem Arp2/3

• Název práce v češtině: Analýza lokalizace endomembránových markerů v kortikální vrstvě rostlinných buněk a jejich interakce s komplexem Arp2/3
• Název v anglickém jazyce: Analysis of endomembrane markers in the cortical cytoplasm and their co-localization with Arp2/3 complex
• Klíčová slova: Arp2/3, aktin, mikrotubuly, rostlinná buňka, plazmatická membrána, endomembrány, Rab
• Klíčová slova anglicky: Arp2/3, actin, microtubules, plant cell, plasma membrane, endomembrane system, Rab
• Akademický rok vypsání: 2018/2019
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra experimentální biologie rostlin (31-130)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Kateřina Schwarzerová, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 07.04.2020
• Datum zadání: 25.06.2020
• Datum odevzdání elektronické podoby: 10.08.2021
• Datum proběhlé obhajoby: 08.09.2021
• Oponenti: Mgr. Matyáš Fendrych, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Cílem diplomového projektu je identifikovat proteiny, proteinové komplexy či organely, které kolokalizují a případně interagují s proteiny komplexu Arp2/3 v kortikální cytoplazmě rostlinných buněk. Pomocí pokročilých technik (TIRF, Spinning disc microscopy, airyscan microscopy) bude sledována dynamika cytoskeletu v kortikální vrstvě rostlinných buněk exprimujících in vivo markery (cytoskeletální proteiny, proteiny podílející se na remodelaci membrán). Za tímto účelem student bude klonováním a dále transformací či křížením rotslinného materiálu připravovat vlastní markerové linie. Případné interakce budou dále potvrzeny pomocí biochemických technik (např. GFP-trap, identifikace pomocí WB). Zvláštní pozornost bude věnována interaktorům, které potenciálně zajišťují proces endocytózy či exocytózy.