Témata prací (Výběr práce)Témata prací (Výběr práce)(verze: 368)
Detail práce
   Přihlásit přes CAS
Morphological, ultrastructural, and transcriptomic characterization of the newly discovered protist lineage SUM-K
Název práce v češtině: Morfologická, ultrastrukturní a transkriptomická charakterizace nově objevené protistní linie SUM-K
Název v anglickém jazyce: Morphological, ultrastructural, and transcriptomic characterization of the newly discovered protist lineage SUM-K
Klíčová slova: extruzómy, eukaryotická diverzita, elektrón transportný reťazec, anaeróbny metabolizmus, mitogenóm
Klíčová slova anglicky: extrusomes, eukaryotic diversity, electron transport chain, anaerobic metabolism, mitogenome
Akademický rok vypsání: 2019/2020
Typ práce: diplomová práce
Jazyk práce: angličtina
Ústav: Katedra zoologie (31-170)
Vedoucí / školitel: prof. RNDr. Ivan Čepička, Ph.D.
Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
Datum přihlášení: 17.11.2019
Datum zadání: 17.11.2019
Datum odevzdání elektronické podoby:11.08.2021
Datum proběhlé obhajoby: 03.09.2021
Oponenti: prof. Ing. Miroslav Oborník, Ph.D.
 
 
 
Konzultanti: Mgr. Tomáš Pánek, Ph.D.
Předběžná náplň práce
Organismus SUM-K byl objeven jako kontaminant laboratorní kultury mořských anaerobních nálevníků na základě analýzy metagenomu společenstva v této kultuře. Nyní je SUM-K k dispozici v monoeukaryotické kultuře. Je to malý bičíkovec s nezvyklou morfologií. Fylogenetická analýza založená na genu pro SSU rRNA ukázala, že SUM-K pravděpodobně představuje dosud neobjevenou hlubokou eukaryotickou linii a že jeho výzkum může pžispět k pochopení evoluce eukaryot jako takových. Z metagenomu byl zrekonstruován mitochondriální genom, který také vykazuje některé zajímavé vlastnosti. Cílem práce je fylogenomická analýza založená na nově získaných transkriptomických datechm, která by měla vyřešit fylogenetickou pozici organismu SUM-K. Transktipromická data budou též použita k predikci energetického metabolismu, jsou totiž indicie, že SUM-K bymohl být fakultativní anaerob nebo mikroaerofil. Další částí bude výzkum bičíkového aparátu pomocí transmisní elektronové mikroskopie.
 
Univerzita Karlova | Informační systém UK