Studium strukturně funkčních vztahů elektron-transportních systémů anaerobní respirace P. aeruginosa metodikou PIXL-MS

• Název práce v češtině: Studium strukturně funkčních vztahů elektron-transportních systémů anaerobní respirace P. aeruginosa metodikou PIXL-MS
• Název v anglickém jazyce: Structure-functional study of electron transport anerobic respiration systems of P. aeruginosa via PIXL-MS approach
• Klíčová slova: azurin, elektronový přenos, technika fotochemického zesítění (PIXL), hmotnostní spektrometrie, L-azidohomoalanin, foto-Met
• Klíčová slova anglicky: azurin, electron transfer, photo-induced cross-linking (PIXL), mass spectrometry, L-azidohomoalanin, photo-Met
• Akademický rok vypsání: 2019/2020
• Typ práce: bakalářská práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra biochemie (31-250)
• Vedoucí / školitel: doc. RNDr. Miroslav Šulc, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 07.11.2019
• Datum zadání: 25.11.2019
• Datum odevzdání elektronické podoby: 14.08.2020
• Datum proběhlé obhajoby: 16.09.2020
• Oponenti: RNDr. Kateřina Bělonožníková, Ph.D.

Zásady pro vypracování

Biochmie, Org. chemie, Metody biochemie I+II, Moderní metody studia proteinů, Struktura biomolekul

Předběžná náplň práce

Práce se zaměřuje na studium proteinu azurinu, který se podílí na elektronovém přenosu v průběhu procesu denitrifikace při anaerobní respiraci některých druhů bakterií (např. P. aeruginosa). Cílem práce bude najít optimální podmínky pro začlenění L-azidohomoalaninu (AHA), strukturního analogu methioninu, do sekvence proteinu, a jeho exprese, purifikace a charakterizace. Finální preparát bude použit pro studium strukturně funkčních vztahů tohoto elektron-transportního systému metodikou PIXL-MS.