Bakteriom stolice při terapii dětských neinfekčních onemocnění

• Název práce v češtině: Bakteriom stolice při terapii dětských neinfekčních onemocnění
• Název v anglickém jazyce: The stool bacteriome during therapy for paediatric non-infectious diseases
• Klíčová slova: bakteriom, stolice, Crohnova choroba, terapie anti-TNFα, 16S rDNA profilování
• Klíčová slova anglicky: bacteriome, stool, Crohn´s disease, anti-TNFα therapy, 16S rDNA profiling
• Akademický rok vypsání: 2019/2020
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra genetiky a mikrobiologie (31-140)
• Vedoucí / školitel: prof. MUDr. Ondřej Cinek, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem, čeká na schválení garantem
• Datum přihlášení: 24.10.2019
• Datum zadání: 24.10.2019
• Datum odevzdání elektronické podoby: 25.04.2021
• Datum proběhlé obhajoby: 26.05.2021
• Oponenti: prof. Ing. Jaroslav Hrabák, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Složení střevního mikrobiomu se u některých dětských imunopatologických chorob buďto podílí na patogenezi, nebo je jejich markerem. Cílem práce bude provést studii reakce bakteriomu na moderní imunomodulační terapii vybraných imunopatologických onemocnění. Kandidát se bude podílet na testování hypotézy, zda imunomodulační terapie povede ke změně střevního mikrobiomu a zda se tato změna bude lišit dle typu onemocnění. Osvojí si laboratorní a základní bioinformatické postupy analýzy bakteriomu a bude se podílet na interpretaci nálezů.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

The composition of the stool microbiome is involved in the pathogenesis of several pediatric immunopathological diseases, either causatively or as a marker. The aim of the present study is to test the reaction of the gut bacteriome to modern immunomodulatory therapy. The candidate will test whether immunomodulatory therapy leads to changes in the gut microbiome, and whether such a change depends on the disease type. The candidate will master relevant laboratory and bioinformatic techniques of bacteriome profiling, and will participate in interpretation of the findings.