Odhalení molekulárních mechanismů opravy abazického meziřetězcového spojení DNA

• Název práce v češtině: Odhalení molekulárních mechanismů opravy abazického meziřetězcového spojení DNA
• Název v anglickém jazyce: Unravelling molecular mechanisms of the abasic crosslink DNA repair
• Klíčová slova: DNA, oprava, replikace, krystalografie, enzymologie, NMR spectroscopy
• Klíčová slova anglicky: DNA repair, replication, crystallography, enzymology, NMR spectroscopy
• Akademický rok vypsání: 2019/2020
• Typ práce: disertační práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra fyzikální a makromol. chemie (31-260)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Mgr. Jan Šilhán, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 09.10.2019
• Datum zadání: 09.10.2019
• Datum odevzdání elektronické podoby: 21.02.2024
• Datum proběhlé obhajoby: 27.03.2024
• Oponenti: RNDr. Cyril Bařinka, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Cílem této práce bude studium molekulárních mechanismů a architektury opravy abazických meziřetězcových spojení DNA. Po přípravě konstruktů a rekombinantních proteinů v bakteriích E. coli bude následovat biofyzikálních charakterizace interakcí a měření enzymových kinetik. Interakční studie budou probíhat za pomocí fluorescenčních technik a elektroforetických metod. Strukturní analýza bude řešena pomocí proteinové X-ray krystalografie a NMR.