Zvýšené hladiny cirkulující volné DNA (cfDNA) v plasmě/séru či hladiny extracelulární DNA (ecDNA) v dalších tělních tekutinách souvisí se záněty a imunitním systémem. Pilotní práce potvrzují imunoregulační účinky této DNA. Zdá se však, že pro funkci cfDNA/ecDNA v buňce je důležitá jak kvantita, tak kvalita stran zastoupení konkrétních sekvencí v poolu této DNA, neboť některé sekvence mají imunostimulační, zatímco jiné imunoinhibiční vliv. Vzhledem k nálezům zvýšených, či naopak snížených hladin cfDNA/ecDNA u mnohých autoimunitních a chronicky zánětlivých onemocnění by schopnost detekce, kvantifikace a analýza jednotlivých typů sekvencí (GC-bohatá ribosomální, telomerická, mitochondriální atd.) mohla rozšířit naše znalosti o etiopatogenezi daných nemocí či konkrétních jejich doprovodných fenotypových projevů, případně by mohla přispět k monitorování progrese onemocnění či ke stanovení prognózy. Diplomová práce si klade za cíl zavést metody kvantifikace vybraných sekvencí DNA z poolu cfDNA/ecDNA, tyto metody otestovat na pilotním souboru pacientů s autoimunitním onemocněním (SLE, axSpA, RA) a zhodnotit jejich využití.
- zadáno vedoucím/školitelem