Variabilita a časová stabilita střevní mikrobioty dětí v závislosti na stravovacích návycích a typu porodu

• Název práce v češtině: Variabilita a časová stabilita střevní mikrobioty dětí v závislosti na stravovacích návycích a typu porodu
• Název v anglickém jazyce: Effect of delivery mode and dietary habits on gut microbiota variability and temporal stability during childhood
• Akademický rok vypsání: 2018/2019
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra zoologie (31-170)
• Vedoucí / školitel: Mgr. Jakub Kreisinger, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Trávicí trakt obratlovců je osídlen bohatou komunitou komenzálních a mutualistických bakterií, které mají zásadní vliv na fenotyp svého hostitele, včetně širokého spektra fyziologických a imunitních znaků. Odchylky od normálního složení mikrobioty tak mohou souviset s celou řadou metabolických a autimunitních poruch.
Porod císařským řezem, který zamezuje osídlení trávicího traktu dítěte vaginální mikrobiotou matky, představuje zásadní zdroj variability ovlivňující složení a vývojovou trajektorii mikrobioty v raných fázích ontogeneze. V pozdějším věku je mikrobiota ovlivňována dalšími faktory, jako je např. složení potravy, léčba antibiotiky a přímý přenos bakterií kontaktem mezi lidmi. Dopadům porodu císařským řezem na složení mikrobioty u kojenců se věnovalo několik předchozích studií. Není však zcela jasné, zda je efekt císařského řezu na strukturu mikrobiálních společenstev dlouhodobější, tj. zda jej lze detekovat i v pozdějších fázích vývoje.
Cílem této práce proto bude zjistit, zda lze u dětí předškolního věku (4-5 let) nalézt rozdíly ve struktuře mikrobiálních společenstev trávicího traktu v závislosti na typu porodu, složení potravy a předešlé medikaci antibiotiky.Diplomantpro svou práci využije vzorky nasbírané v rámcijiné rozsáhlejšístudie. Část vzorků je v současné době již k dispozici, sběr dat bude dokončen v následujícím kalendářním roce. Úkolemdiplomantabude analyzovat složení střevní mikrobioty za pomocí hlubokého sekvenování genu pro bakteriální 16S rRNA a následně pak bioinformatické a statistické zpracování výsledných sekvenčních dat.