fosforylace, strukturní charakterizace fosforylačních míst, predikce fosforylačních míst, konformační změny proteinových struktur
Klíčová slova anglicky:
phosphorylation, structural characterization of protein phosphorylation site, protein phosphorylation sites prediction, conformational changes of protein structures
Fosforylace jsou důležitou posttranslační modifikací proteinů a mají vliv na strukturu i funkci proteinu. Změny ve fosforylacích mohou vést k závažným onemocněním. Experimentální určení struktur je stále relativně náročnou a drahou záležitostí, a proto hrají stále významnou úlohu i predikce fosforylaci. V zájmu zvýšení věrohodnosti predikce se stále vyvíjejí nové metody. Metody pro predikci fosforylačních míst však stále jen ve velmi omezené míře využívají strukturní data. Cílem předkládaného projektu je provést pečlivou analýzu dostupných strukturních dat o fosforylacích a pokusit se v nich nalézt obecně použitelné zákonitosti, které pomohou zpřesnit predikci fosforylačních míst.
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce
Phosphorylations are essetial post-translational modification of proteins and they affect structure and function of protein. Changes in phosphorylation status can cause serious diseases. Experimental determination of structures is still relatively difficult and expensive, and therefore prediction of phosphorylations are frequently used. To increase reliability, new methods of prediction are still developed. Current methods for phosphorylation prediction hardly ever usef structural data. The objective of this project is to perform exhaustive analysis of the available structural data on phosphorylation and try to find generaly applicable patterns in them that would help to refine the prediction of phosphorylation sites.
- zadáno vedoucím/školitelem