Umlčování exprese transgenů v rostlinách bramboru a v buněčné linii tabáku BY-2
Název práce v češtině: | Umlčování exprese transgenů v rostlinách bramboru a v buněčné linii tabáku BY-2 |
---|---|
Název v anglickém jazyce: | Transgene silencing in potato plants and tobacco cell line BY-2 |
Akademický rok vypsání: | 2017/2018 |
Typ práce: | rigorózní práce |
Jazyk práce: | čeština |
Ústav: | Katedra experimentální biologie rostlin (31-130) |
Vedoucí / školitel: | |
Řešitel: | skrytý![]() |
Datum přihlášení: | 17.05.2018 |
Datum zadání: | 17.05.2018 |
Datum potvrzení stud. oddělením: | 06.06.2018 |
Datum odevzdání elektronické podoby: | 17.05.2018 |
Datum proběhlé obhajoby: | 25.06.2018 |
Předběžná náplň práce |
Vnesení transgenu do rostlinné buňky a ověření jeho integrace do genomu není zárukou jeho stabilní exprese. Na úrovni jednotlivých buněk totiž mnohdy dochází k rozpoznávání transkriptů vnesených genů (jejich degradačních produktů) a vyvolání obranné reakce - RNA interference (silencingu) - vedoucího k cílené degradaci mRNA daného genu (popř. až zastavení transkripce genu v důsledku metylace DNA a změny struktury chromatinu). Tento mechanismus umlčování genové exprese (tzv. silencing) je rostlinami využíván (a možná i původně vytvořen) na ochranu proti virové infekci. Proto se informace o nutnosti umlčet expresi příslušných genů ve formě siRNA šíří mezi sousedními buňkami i prostřednictvím floémového toku na úrovni celé rostliny. Diplomová práce naváže na aktuální výsledky týmu v některé z těchto problematik - studium stability exprese transgenů, jejich samovolného či indukovaného umlčování, reaktivace jejich exprese a analýz methylačního stavu DNA. Modelové organismy: lilek brambor, tabáková buněčná linie BY-2. Metodiky: isolace a analýzy nukleových kyselin (PCR, hybridizace), hydrogensiřičitanové sekvenování, fluorescenční mikroskopie (detekce GFP), přípravy genových konstruktů a transformace rostlinných buněk (příprava a analýzy transgenních rostlin), ... |