Analýza vztahu mezi funkcí proteinového komplexu ARP2/3 a exocytózou v rostlinných buňkách

• Název práce v češtině: Analýza vztahu mezi funkcí proteinového komplexu ARP2/3 a exocytózou v rostlinných buňkách
• Název v anglickém jazyce: Analysis of the relationship between the function of the ARP2/3 protein complex and exocytosis in plant cells
• Klíčová slova: komplex Arp2/3, rostlinná buňka, aktinový cytoskelet, růst buňky, exocytóza, exocyst, pylová láčka, hypokotyl
• Klíčová slova anglicky: Arp2/3 complex, plant cell expansion, actin cytoskeleton, exocytosis, exocyst, pollen tube, hypocotyl
• Akademický rok vypsání: 2020/2021
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra experimentální biologie rostlin (31-130)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Kateřina Schwarzerová, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd.
• Datum přihlášení: 15.02.2021
• Datum zadání: 18.02.2021
• Datum potvrzení stud. oddělením: 18.02.2021
• Datum odevzdání elektronické podoby: 12.12.2023
• Datum proběhlé obhajoby: 26.01.2024
• Oponenti: Mgr. Lukáš Synek, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Cílem projektu je analyzovat interakce jednotlivých proteinů komplexu Arp2/3 in vitro. Práce je založena na probíhajících experimentech laboratoře, ve kterých jsou produkovány rekombinantní podjednotky komplexu a je studována jejich interakce s dalšími proteiny. V projektu budou využívány purifikované rekombinantní proteiny a metody 2D elektroforézy a koimunoprecipitace. Bude zjišťována interakce s mikrotubuly/tubulinem a aktinovým cytoskeletem, případně dalšími proteiny. Kromě in vitro analýz bude využívána i mikroskopie (především TIRF) pro validaci výsledků in vivo. Výsledky budou vyhodnocovány pomocí obrazové analýzy.
Téma je součástí širšího zaměření laboratoře a běžících grantů na toto téma.