Strukturní biologie receptoru NKp44 a jeho ligandu PCNA

• Název práce v češtině: Strukturní biologie receptoru NKp44 a jeho ligandu PCNA
• Název v anglickém jazyce: Structural biology of receptor NKp44 and its ligand PCNA
• Klíčová slova: NK buňka, NKp44, PCNA, HEK293, MST
• Klíčová slova anglicky: NK cell, NKp44, PCNA, HEK293, MST
• Akademický rok vypsání: 2017/2018
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra biochemie (31-250)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Ondřej Vaněk, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 15.11.2017
• Datum zadání: 15.12.2017
• Datum odevzdání elektronické podoby: 04.05.2019
• Datum proběhlé obhajoby: 21.05.2019
• Oponenti: Mgr. Božena Kubíčková, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Náplní práce bude rekombinantní exprese rozpustných forem lidských NK buněčných receptoru NKp44 a studium jeho interakce s ligandem PCNA s cílem jejího strukturního popisu. Rekombinantní exprese proteinů v bakteriálním systému i v lidské buněčné linii HEK293, purifikace proteinů a jejich charakterizace pomocí analytické ultracentrifugace a rezonance povrchového plazmonu, krystalizace proteinů a řešení jejich struktury pomocí proteinové krystalografie.

Tato práce je součástí projektu "Harnessing soluble forms of NK cell receptors and their ligands for the generation of novel anticancer immunotherapeutics" podpořeného prestižní cenou Instruct R&D Pilot Project Award z evropského programu Instruct a také projektem Grantové agentury ČR.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

The aim of the thesis is recombinant expression of soluble forms of human NK cell receptor NKp44 and study of its interaction with the PCNA ligand with respect to structural description of this interaction. Recombinant protein expression in both bacterial and human HEK293 cell line expression systems, protein purification and characterization by analytical ultracentrifugation and surface plasmon resonance, protein crystallization and structure solution by protein crystallography.

This work is part of project "Harnessing soluble forms of NK cell receptors and their ligands for the generation of novel anticancer immunotherapeutics" supported by prestigious Instruct R&D Pilot Project Award from the European programe Instruct and also by project from Czech Science Foundation.