Anotace sekundární struktury
| Název práce v češtině: | Anotace sekundární struktury |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce: | Secondary structure assignment |
| Klíčová slova: | helix, list, assignment, anotace, sekundární struktura, algoritmus |
| Klíčová slova anglicky: | helix, sheet, assignment, secondary structure, algorithm |
| Akademický rok vypsání: | 2017/2018 |
| Typ práce: | bakalářská práce |
| Jazyk práce: | čeština |
| Ústav: | Katedra buněčné biologie (31-151) |
| Vedoucí / školitel: | Mgr. Marian Novotný, Ph.D. |
| Řešitel: | skrytý - zadáno vedoucím/školitelem |
| Datum přihlášení: | 23.11.2017 |
| Datum zadání: | 04.01.2018 |
| Datum odevzdání elektronické podoby: | 07.05.2018 |
| Datum proběhlé obhajoby: | 10.09.2018 |
| Oponenti: | Mgr. Vjačeslav Treťjačenko, Ph.D. |
| Předběžná náplň práce |
| Jako sekundární struktury proteinů jsou označovány konzervované motivy struktur vznikající díky slabým vazebným interakcím.
V úvodu práce se zaměřuji na popis a charakterizaci sekundárních struktur. Speciální pozornost je věnována popisu vzácnějších typů helikálních sekundárních struktur, jako jsou 310-helixy či π‑helixy. Jádrem práce je však přehled a zhodnocení existujících metod, které umí ve 3D strukturách proteinů takovéto motivy identifikovat. |
| Předběžná náplň práce v anglickém jazyce |
| Protein secondary structures are conserved motifs of structures resulting from weak binding interactions.
At the beginning of this thesis I focus on description and characterization of secondary structures. Special attention is paid to the description of rarer types of helical secondary structures such as 310-helixes or π-helixes. At the core of the thesis, however, is an overview and an evaluation of existing methods that are able to identify such motifs in protein 3D structures. |