Sestřihové snRNP částice jsou komplexní molekuly, které se skládají z malé jaderné RNA (snRNA) a několika bílkovin, které jsou na snRNA navázány. Formování sestřihových snRNP částic probíhá v několika postupných krocích, které jsou katalyzovány podpůrnými faktory. V nedávné době jsme ukázali, že komplex R2TP společně s HSP90 asistují při skládání U5 snRNP částic. Při analýze proteinů, které váží R2TP komplex jsme narazili na protein TSSC4, který silně interaguje s R2TP komplexem i s nehotovými U5 snRNP komplexy. Cílem této diplomové práce bude zkoumat funkci TSSC4 při formování U5 snRNP částice. Student bude používat základní i pokročilé mikroskopické a molekulárně biologické metody např. klonování DNA, RNA interferenci, konfokální a high-content mirkoskopii, imunoprecipitace apod.
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce
Spliceosomal snRNP particles are complex molecules consisting of small nuclear RNA (snRNA) and several proteins bound to snRNA. The formation of spliceosomal SNRNPs takes place in several successive steps which are catalyzed by supporting factors. Recently, we have shown that R2TP together with HSP90 assists in assembly of U5 snRNP particles. When analyzing the proteins that bind the R2TP complex, we encountered a TSSC4 protein that strongly interacts with the R2TP complex and with U5 snRNP assembly intermediates. The aim of this diploma thesis is to examine the function of TSSC4 in the formation of U5 snRNP particles. The student will use both basic and advanced microscopic and molecular biological methods such as DNA cloning, RNA interference, confocal and high-content mirroroscopy, immunoprecipitation, etc.
- zadáno vedoucím/školitelem