Modelování vlivu složení fosfolipidové membrány na strukturu a dynamiku cytochromů P450.

• Název práce v češtině: Modelování vlivu složení fosfolipidové membrány na strukturu a dynamiku cytochromů P450.
• Název v anglickém jazyce: Modeling of an influence of a phospholipid membrane composition on the structure and dynamics of cytochromes P450s.
• Klíčová slova: cytochrom P450 1A2, molekulová dynamika, membránové proteiny
• Klíčová slova anglicky: cytochrome P450 1A2, molecular dynamics, membrane proteins
• Akademický rok vypsání: 2017/2018
• Typ práce: bakalářská práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra biochemie (31-250)
• Vedoucí / školitel: Mgr. Petr Jeřábek, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 23.10.2017
• Datum zadání: 23.10.2017
• Datum odevzdání elektronické podoby: 19.08.2019
• Datum proběhlé obhajoby: 05.09.2019
• Oponenti: Petr Kulhánek, Dr.

Předběžná náplň práce

V průběhu práce se student seznámí s metodami molekulového modelování, které jsou vhodné pro studium interakce proteinů s fosfolipidovou membránou. V první fázi bude použita technika tzv. "self assemblingu", která je vhodná pro získání přibližné konformace proteinu ve fosfolipidové membráně. V dalším kroku budou získané protein-membránové komplexy optimalizovány a studovány metodou molekulové dynamiky. Výsledky budou poté korelovány s dostupnými experimentálními daty. Vzhledem k povaze práce je téma vhodné pro studenta znalého základů informatiky.
Pokud máte o tuto práci zájem, prosím kontaktujte mne, rád Vám poskytnu bližší informace, popř. přizpůsobím téma práce.