Patogenetické mechanismy imunitní dysregulace a hematopoetických onemocnění

• Název práce v češtině: Patogenetické mechanismy imunitní dysregulace a hematopoetických onemocnění
• Název v anglickém jazyce: Pathogenetic mechanisms of immune dysregulation and hematopoietic disorders
• Klíčová slova: Sekvenování nové generace, celoexomové sekvenování, vrozené poruchy imunity, imunitní cytopenie, anémie
• Klíčová slova anglicky: Next generation sequencing, whole exome sequencing, inborn errors of immunity, immune cytopenias, anemia
• Akademický rok vypsání: 2016/2017
• Typ práce: disertační práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Klinika dětské hematologie a onkologie (13-462)
• Vedoucí / školitel: prof. MUDr. Eva Froňková, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd.
• Datum přihlášení: 28.10.2016
• Datum zadání: 28.10.2016
• Datum potvrzení stud. oddělením: 28.10.2016
• Datum a čas obhajoby: 13.09.2022 11:00
• Datum odevzdání elektronické podoby: 26.06.2022
• Datum odevzdání tištěné podoby: 29.06.2022
• Datum proběhlé obhajoby: 13.09.2022
• Oponenti: RNDr. Dominik Filipp, CSc.

Seznam odborné literatury

Casanova, Jean-Laurent, et al. 2014. Guidelines for genetic studies in single patients: lessons from primary immunodeficiencies. The Journal of Experimental Medicine. 211(11), 2137–2149. doi: 10.1084/jem.20140520
Fischer, Alain, et al., 2017. Autoimmune and inflammatory manifestations occur frequently in patients with primary immunodeficiencies. The Journal of Allergy and Clinical Immunology. 140(5), 1388-1393.e8. doi: 10.1016/j.jaci.2016.12.978
Stray-Pedersen, Asbjørg, et al., 2017. Primary immunodeficiency diseases: Genomic approaches delineate heterogeneous Mendelian disorders. Journal of Allergy and Clinical Immunology. 139(1), 232–245. doi: 10.1016/j.jaci.2016.05.042

Předběžná náplň práce

Cílem práce je zavedení vyšetření pomocí celoexomového sekvenování (WES) u dětských pacientů s podezřením na vrozenou poruchu imunity (IEI) nebo selhání kostní dřeně. U nově identifikovaných variant budou navrženy validační experimenty za účelem potvrzení kauzality identifikovaných mutací v patogenezi onemocnění. Na základě identifikovaných kauzálních genetických variant bude navržena léčba těchto pacientů a možnosti sledování klinické odpovědi.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

The aim of this work is to introduce whole exome sequencing (WES) in pediatric patients with suspected inborn error of immunity (IEI) or hematopoiesis. Validation experiments will be designed for newly identified variants in order to confirm the causality of the identified variants in the pathogenesis of the disease. Based on the identified causal variants, treatment of these patients and options for monitoring of the clinical response will be proposed.