skrytý - zadáno vedoucím/školitelem, čeká na schválení garantem
Datum přihlášení:
21.10.2016
Datum zadání:
21.10.2016
Datum odevzdání elektronické podoby:
21.07.2019
Datum proběhlé obhajoby:
04.09.2019
Oponenti:
doc. Mgr. Pavel Němec, Ph.D.
Předběžná náplň práce
Ryby žijící v extrémním prostředí (jako jsou hluboké nebo trvale zakalené vody) se v evolučním měřítku přizpůsobily snížené intenzitě světla i jinému barevnému složení spektra. Ryby jsou obecně schopny velmi dobrého barevného vnímání a to díky široké paletě fotoreceptorů přítomných v sítnici. Fotoreceptorové proteiny (tzv. opsiny) jsou přítomné v membránách buněk sítnice, konkrétně v tyčinkách a čípcích. Ryby mají několik typů čípků a tyčinek uspořádaných často v mozaikovité struktuře. Dle současných poznatků se předpokládá, že v jedné fotoreceptorové buňce lze vždy nalézt pouze jeden opsinový gen, což určuje přesnou citlivost buňky v úzkém rozpětí barevného spektra. Více typů čípků v sítnici pak zajišťuje barevné vidění. V poslední době se ovšem ukazuje, že pravidlo výlučné genové exprese úplně neplatí, některé buňky obsahují několik typů opsinů a tím mají širší (ale méně přesnou) citlivost. Ve své diplomové práci se studentka zaměří na testování hypotéz o 1) možném mechanismu barevného vidění za výlučného využití tyčinek u kapra obecného (Cyprinus carpio), což by byl u obratlovců unikát, a na 2) vliv podmínek hluboké vody na uspořádání a funkci sítnice u cichlid z hlubokých vod (druh Konia dikume) a z mělkých vod (Konia eisentrauti) kráterového jezera. Diplomová práce bude zaměřena konkrétně na vizualizaci jednotlivých typů fotoreceptorů v sítnici pomocí moderní metody fluorescenční in-situ hybridizace (FISH) a využitím RNA sond, rekonstrukci sítnicové mozaiky vybraných druhů a testování ko-exprese fotoreceptorových genů v jednotlivých buňkách sítnice.
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce
Fishes from the extreme environments (such as deep or permanently turbid waters) have adapted to lower light intensity and different color composition of the light spectrum. Fish are generally able of very good color vision thanks to the presence of several photoreceptors in retina. Photoreceptor proteins (opsins) are present in membranes of the cone and rod cells in retina. Fish have various types of cones and rods organized in the retinal mosaic. As traditionally claimed, one cell expresses only one photoreceptor gene, which is making the cell sensitive in a narrow, but precise, range of color spectrum. Therefore various cone cell types in retina mediate color vision. Recent findings raised doubts about such exclusive expression; instead more opsin types have been found in one cell in some cases, which changes the sensitivity to a broader, but less precise, color range. The proposed Master thesis will be focused on testing the hypotheses about 1) potential mechanism of color vision based solely on rods in Common carp (Cyprinus carpio), which would represent an unique mechanism among vertebrates; and, 2) effect of depth on the function and organization of retina in cichlids from deep (Konia dikume) and shallow (Konia eisentrauti) environments of the crater lake. In detail, the proposed Master thesis will be focused on visualization of photoreceptor cells in retina by the modern method of fluorescent in-situ hybridization (FISH) employing the RNA probes, reconstruction of retinal mosaic in the model species, and test of co-expression of photoreceptor genes in rod and cone cells of retina.
- zadáno vedoucím/školitelem, čeká na schválení garantem