Localization and quantification of mRNA coding digestive peptidases of Fascioloides magna

• Název práce v češtině: Lokalizace a kvantifikace mRNA kódující trávící peptidázy motolice Fascioloides magna
• Název v anglickém jazyce: Localization and quantification of mRNA coding digestive peptidases of Fascioloides magna
• Klíčová slova: Fascioloides magna, dospělci, miracidia, PCR, qPCR, RNA in situ hybridizace, katepsin L, imunohistochemie
• Klíčová slova anglicky: Fascioloides magna, adults, miracidia, PCR, qPCR, RNA in situ hybridisation, cathepsin L, imunohistochemistry
• Akademický rok vypsání: 2016/2017
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: angličtina
• Ústav: Katedra parazitologie (31-161)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Martin Kašný, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 19.10.2016
• Datum zadání: 19.10.2016
• Datum odevzdání elektronické podoby: 28.04.2019
• Datum proběhlé obhajoby: 30.05.2019
• Oponenti: RNDr. Daniel Sojka, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Fascioloides magna (motolice obrovská, Bassi 1875) je významná patogenní motolice parazitující v játrech volně žijících, ale i domácích přežvýkavců v Severní Americe a Evropě, včetně České republiky.
Diplomová práce by měla navázat na výsledky, kterých bylo nedávno dosaženo v v Laboratoři helmintologie (katedra parazitologie, Př.f., UK), kde byla v nedávné době charakterizována dominantní cysteinová peptidáza F. magna – katepsin L (FmCL, anotační číslo v databázi GenBank: ACG50798).
Jednou z významných funkcí FmCL je pravděpodobná participace na trávení hostitelské krve dospělými motolicemi. Jelikož předběžné výsledky naznačují, že gen kódující tuto peptidázu je významně exprimován i u dalších ontogenetických stádií např. miracidií, která potravu nepřijímají, existuje předpoklad odlišné tkáňové lokalizace proteinu a exprese genu FmCL.
Cíle diplomové práce:
1. Zpracovat dostupnou literaturu orientovanou na možnosti sledování genové exprese u helmintů, zejména qPCR a in situ RNA.
2. Prostřednictvím PCR, qPCR, northern blot analýzy a in situ RNA hybridizace, zjistit přítomnost FmCL RNA a měřit úroveň exprese genu pro FmCL u miracidí a dospělců F. magna.
3. S využitím imuno-histochemických metod lokalizovat FmCL ve formě proteinu u miracidí a dospělců F. magna.