From Ion Flows to Hearing: A Multiscale Computational Model of the Inner Ear
| Název práce v češtině: | Od iontových proudů ke sluchu: Mnohaměřítkový výpočetní model vnitřního ucha |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce: | From Ion Flows to Hearing: A Multiscale Computational Model of the Inner Ear |
| Klíčová slova: | sluchový systém|výpočetní modelování|kochlea|vláskové buňky|iontové proudy|napěťově řízené iontové kanály|stužková synapse|difuze vápníku|fyziologie sluchu |
| Klíčová slova anglicky: | Auditory system|Computational modeling|Cochlea|Hair cells|Ion flows|Voltage-gated ion channels|Ribbon synapse|Calcium diffusion|Hearing physiology |
| Akademický rok vypsání: | 2017/2018 |
| Typ práce: | disertační práce |
| Jazyk práce: | angličtina |
| Ústav: | Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v.v.i. (32-UOCHAV) |
| Vedoucí / školitel: | prof. Mgr. Pavel Jungwirth, CSc., DSc. |
| Řešitel: | skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd. |
| Datum přihlášení: | 20.09.2017 |
| Datum zadání: | 20.09.2017 |
| Datum potvrzení stud. oddělením: | 03.10.2017 |
| Datum a čas obhajoby: | 11.06.2025 14:00 |
| Datum odevzdání elektronické podoby: | 17.03.2025 |
| Datum odevzdání tištěné podoby: | 01.04.2025 |
| Datum proběhlé obhajoby: | 11.06.2025 |
| Oponenti: | prof. Anthony Wiliam Gummer |
| Ing. Václav Vencovský, Ph.D. | |
| Zásady pro vypracování |
| 1. rešerše dostupné literatury
2. seznámení se s existujícím matlabovským modelem vnitřního ucha 3. vývoj počítačového modelu a provedení modelových výpočtů převodu akustického signálu na excitaci sluchového nervu 4. vývoj elektrického modelu vnitřního ucha směrem k modelování poškozeného sluchu a kochleárního implantátu |
| Seznam odborné literatury |
| James O. Pickles. An Introduction to the Physiology of Hearing, Fourth Edition.
Bingley: Emerald Group, 2012. isbn: 978-1-78052-166-4. Eberhard Griepentrog and Roswitha März. Differential-Algebraic Equations and Their Numeriacal Treatment. Lepzig: BSB Teubner, 1986. isbn: 3-322-00343-4. Pavel Mistrík and Jonathan Ashmore. “Reduced Electromotility of Outer Hair Cells Associated with Connexin-Related Forms of Deafness: An In silico Study of a Chochlear Network Mechanism”. In: Journal of the Association for Research in Otolaryngology 11 (2010), pp. 559–571. Pavel Mistrík et al. “Three-dimensional current flow in a large-scale model of the cochlea and the mechanism of amplification of sound”. In: J. R. Soc. Interface 6 (2009), pp. 279–291. Ian C. Bruce. “Evaluation of Stochastic Differential Equation Approximation of Ion Channel Gation Models”. In: Annals of Biomedical Engineering 37 (Apr. 2009), pp. 824–838. Manual for MATLAB and Parallel Toolbox Release 2013b. Natick, Massachusetts, United States: The MathWorks, Inc. |