Diverzita sekvencí mtDNA a genetická struktura východoafrického sahelu

• Název práce v češtině: Diverzita sekvencí mtDNA a genetická struktura východoafrického sahelu
• Název v anglickém jazyce: Sequence diversity of mtDNA and genetic structure of eastern part of the African Sahel
• Klíčová slova: mitochondriální DNA, Afrika, evoluční genetika člověka
• Klíčová slova anglicky: mitochondrial DNA, Africa, human evolutionary genetics
• Akademický rok vypsání: 2015/2016
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra antropologie a genetiky člověka (31-110)
• Vedoucí / školitel: prof. Mgr. Viktor Černý, Dr.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem, čeká na schválení garantem
• Datum přihlášení: 11.11.2015
• Datum zadání: 11.11.2015
• Datum odevzdání elektronické podoby: 14.08.2017
• Datum proběhlé obhajoby: 12.09.2017
• Oponenti: doc. Mgr. Pavel Munclinger, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Cílem této diplomové práce je určit populační strukturu a odhadnout migrační aktivitu u populací východní části afrického sahelu analýzou kompletního kontrolního úseku mtDNA. V úrovni laboratorního zpracování je k dispozici šest populačních vzorků ze Súdánu a tři z Čadu (přibližně 400 jedinců), jejichž HVS-1 segment je již osekvenován. Vlastní práce se bude v letošním školním roce sestávat z PCR amplifikace a sekvenace HVS-2 segmentu a vytvoření databáze, to vše za asistence Mgr. Martiny Čížkové v archeogenetické laboratoři Archeologického ústavu v Praze. V druhém roce studia budou za pomoci dostupných statistických programů (Arlequin, DnaSP) zjištěny základní parametry genetické diverzity jednotlivých populací a rekonstruována jejich vzájemná diferenciace ve vztahu ke geografickému původu.