Korelace imunohistochemických a molekulárně biologických metod v diagnostice nádorů slinných žláz

• Název práce v češtině: Korelace imunohistochemických a molekulárně biologických metod v diagnostice nádorů slinných žláz
• Název v anglickém jazyce: Correlation of Immunohistochemical and Molecular Methods in Diagnostics of Salivary Gland Tumors
• Klíčová slova: Slinné žlázy, imunohistochemie, molekulárně-genetické metody, translokace, dvoustupňový screening, cytologie, tenkojehlová aspirace, Milánský systém, doplňková vyšetření
• Klíčová slova anglicky: Salivary glands, immunohistochemistry, molecular genetic methods, translocation, 2-step diagnostic test, cytology, fine-needle aspiration, Milan system, ancillary studies
• Akademický rok vypsání: 2015/2016
• Typ práce: disertační práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Šiklův ústav patologie (14-500)
• Vedoucí / školitel: prof. MUDr. Alena Skálová, CSc.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 05.10.2015
• Datum zadání: 05.10.2015
• Datum a čas obhajoby: 25.06.2019 13:30
• Datum odevzdání elektronické podoby: 11.07.2019
• Datum proběhlé obhajoby: 25.06.2019
• Oponenti: prof. MUDr. Jan Laco, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Doktorská disertační práce se zabývá korelací morfologického, imunohistochemického a molekulárně-genetického nálezu v maligních nádorech slinných žláz. V první části jsou shrnuty současné poznatky týkající se salivárních malignit. V druhé části je prezentován vlastní výzkum.
Druhá polovina disertační práce se týká přímo výsledků vlastního výzkumu a je rozdělena do tří částí. V první části je představena metoda „dvoustupňového screeningu“ maligních nádorů, který má za cíl nalézt nové, doposud nepopsané genové aberace se zaměřením na zhoubné nádory slinných žláz. Tato metoda probíhá ve dvou na sebe navazujících krocích, kdy je materiál nejdříve vyšetřen imunohistochemicky směsí protilátek nespecificky detekující aberace v genech NTRK1-3, ALK a ROS1. Pozitivní případy jsou dále podrobeny vysoce senzitivnímu i specifickému molekulárně-genetickému vyšetření metodou masivního paralelního sekvenování s použitím Archer kitu.
V druhé části výsledků je vypracován postup pro cytologickou diagnostiku sekrečního karcinomu slinných žláz z tenkojehlové aspirace (FNA). V této části je detailně popsána cytomorfologie sekrečního karcinomu v nátěrech obarvených dle Papanicolaoua i v cytobloku, ze kterého jsou následně provedena doplňková imunocytochemická a genetická vyšetření. Výsledky dostupných vyšetření jsou dány do kontextu s kategorizací dle Milánského systému. Dále byl navržen základní vyšetřovací panel protilátek, jehož výsledky podporují diagnózu sekrečního karcinomu.
V poslední části jsou pak krátce komentovány tři publikované články, které se přímo týkají tématu práce. Jeden prvoautorský článek publikovaný v recenzovaném časopise pojednává o přínosu Milánského systému reportování do rutinní cytologické praxe. Dále jsou komentovány dva spoluautorské články. První se týká dvou případů sekrečního karcinomu dutiny nosní. Druhý článek popisuje tři případy světlobuněčného karcinomu, u kterých byla objevena nová genová translokace EWSR1-CREM.
 

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

This doctoral thesis is dealing with the correlation of morphological, immunohistochemical and genetical findings in malignant tumors of salivary glands. The first half of the thesis comprises the summary of current knowledge about salivary malignancies. The second half is presenting the research itself.
The research results are divided into three parts. The first part is presenting the method of “2-step diagnostic test” of malignant tumors. This screening test aims to find new, so far not described gene aberrations with a focus on malignant tumors of salivary glands. This method takes place in two consecutive steps. In the first step the material is examined by an immunohistochemical mixture of antibodies, which non-specifically detects aberration in the genes NTRK1-3, ALK and ROS1. In the second step all positive cases are subjected to highly sensitive and specific molecular-genetic examination by the method of next generation sequencing (NGS) using the Archer kit.
In the second part of the work there has been designed the approach to the cytological diagnosis of salivary secretory carcinoma by the fine-needle aspiration (FNA). This part is describing to the details the cytomorphology of secretory carcinoma in both, Pap smears and cell blocks, from which additional immunocytochemical and genetic examinations are performed. The results of available examinations are put into context with the categorization according to the Milan system. Furthermore, we have designed a basic antibody screening panel. Its results support the diagnosis of secretory carcinoma.
The last part comprises shortly commented three articles, which are directly related to the topic of the thesis. One first-authored article published in a reviewed journal is describing the contribution of the Milan reporting system to the routine cytology practice. There are another two co-authorial articles. The first one is concerning two cases of secretory carcinoma of the nasal cavity. Second article is describing three cases of clear cell carcinoma harboring a newly discovered EWSR1-CREM gene translocation.