Změny v distribuci subpopulací B lymfocytů u pacientů s Crohnovou chorobou před a po biologické léčbě

• Název práce v češtině: Změny v distribuci subpopulací B lymfocytů u pacientů s Crohnovou chorobou před a po biologické léčbě
• Název v anglickém jazyce: Changes in distribution of B lymphocyte subpopulations in patients with Crohn disease before and after biological therapy
• Klíčová slova: imunofenotyp, vícebarevná průtoková cytometrie, B lymfocyt, B buněčné subpopulace, Crohnova choroba, anti-TNF léčba
• Klíčová slova anglicky: immunophenotype, polychromatic flow cytometry, B lymphpocyte, B cell subpopulations, Crohn disease, anti-TNF therapy
• Akademický rok vypsání: 2014/2015
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra buněčné biologie (31-151)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Šárka Růžičková, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 28.11.2014
• Datum zadání: 28.11.2014
• Datum odevzdání elektronické podoby: 15.08.2016
• Datum proběhlé obhajoby: 16.09.2016
• Oponenti: doc. RNDr. Magdaléna Krulová, Ph.D.

Předběžná náplň práce

1) Analýza B-lymfocytů širokého spektra vývojových stádií periferní B lymfopoezy (tj. od T1 B buněk po terminální plazmatická stádia) u zdravých kontrol a u pacientů s Crohnovou chorobou, včetně pacientů před a po anti-TNF léčbě.
2) Vytvoření database zahrnující cytometrická data a klinická data od každého studovaného subjektu a její udržování.
3) Identifikace imunofenotypových vzorů specifických nebo unikátních pro konkrétní typ nebo formu onemocnění a zaznamenání změn v závislosti na použité léčbě a navržení jednoduchého grafického znázornění takovéhoto imunofenotypu, které bude jednoduše prezentovatelné lékařům v klinické praxi.
4) Vytvoření schémat na bázi tzv. “heat” mapy, pomocí nichž bude možné seskupit jedince s podobnými imunofenotypy do skupin a s podobnými distribucemi jednotlivých B buněčných stádií (podobně jako u expresních profilů na cDNA čipech).
5) Korelaci cytometrických a klinických dat.
6) Identifikace B buněčných subpopulací, které budou použitelné jako diagnosticko-predikční marker v klinické praxi.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

1) Analysis of B lymphocytes of a wide developmental stages of peripheral B cell lymphopoiesis (i.e. from T1 B cells to terminally differentiated plasma cells) in normal healthy subjects (NHS) and patiens with Crohn disease, including those before and after anti-TNF therapy.
2) Generation of database including flow cytometry and clinical data of every examined individual and its maintenance.
3) Identification of immunophenotype patterns specific or unique for particular type or form of disease and detection of their changes dependent on administered therapy. Desing of graphical image of a such immunopattern, which will be possible easily to present to clinicians.

4) Generattion of shemes on basis of “heat maps” that will be able to group subjects carrying similar immunophenotype patterns and distribution of individual B cell stages (resembling expression profiles of cDNA chips).
5) Correlation between flow cytometry and clinical data.
6) Identification of B cell subpopulation applicable as diagnostic/predictive biomarker in clinical practice.