Variabilita ve složení gastrointestiní mikrobioty napříč trávicím traktem u obratlovců

• Název práce v češtině: Variabilita ve složení gastrointestiní mikrobioty napříč trávicím traktem u obratlovců
• Akademický rok vypsání: 2014/2015
• Typ práce: bakalářská práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra zoologie (31-170)
• Vedoucí / školitel: Mgr. Jakub Kreisinger, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Trávicí trakt obratlovců je kolonizován taxonomicky a početně velmi bohatou komunitou komenzálních a symbiotických bakterií. Celkový počet bakteriálních buněk více než řádově přesahuje počet somatických buněk v těle hostitele a ještě větší disproporce jsou mezi počtem genů kódovaných tímto bakteriálním metagenomem a genomem hostitele. Gatrointestinální mikrobiota (GM) ovlivňuje zásadním způsobem fyziologii hostitele a imunitu hostitele. Konkrétně se podílí na obraně proti gastrointestinálních patogenů, zvyšuje efektivitu trávení přijímané potravy, má přímý vliv na morfologii trávicího traktu fungování centrálního nervového systému a vývoj kognitivních vlastností.
Většina současných studií na toto téma sleduje vliv GM na fenotypové vlastnosti hostitele pouze na základě analýz vzorků GM z distálních částí tlustého střeva. Avšak GM vykazuje značnou variabilitu ve složení napříč trávicím traktem a není proto jasné, do jaké míry GM v jednotlivých částech trávicího traktu ovlivňuje fenotyp hostitele.
Úkolem studenta vypracovat na základě dostupné literatury komparativí studii, která by posoudila variabilitu GM napříč trávicím traktem a jejjí vliv na fenotypové vlastnosti hostitele u obratlovců.
Preferujme studenty, kteří by měli zájem v tomto tématu pokračovat i během magisterského studia a ideálně se podílet na laboratorních pracích již během řešení bakalářského projektu (viz téma diplomové práce: “Variabilita ve složení gastrointestiní mikrobioty napříč trávicím traktem ptáků„).
Literatura
Stearns, J. C., Lynch, M. D., Senadheera, D. B., Tenenbaum, H. C., Goldberg, M. B., Cvitkovitch, D. G., ... & Neufeld, J. D. (2011). Bacterial biogeography of the human digestive tract. Scientific reports, 1.
Keenan, S. W., Engel, A. S., & Elsey, R. M. (2013). The alligator gut microbiome and implications for archosaur symbioses. Scientific reports, 3.
Faust, K., Sathirapongsasuti, J. F., Izard, J., Segata, N., Gevers, D., Raes, J., & Huttenhower, C. (2012). Microbial co-occurrence relationships in the human microbiome. PLoS computational biology, 8(7), e1002606.