Raritní populace B lymfocytů na pozadí periferní B lymfopoézy u lidí

• Název práce v češtině: Raritní populace B lymfocytů na pozadí periferní B lymfopoézy u lidí
• Název v anglickém jazyce: Rare B lymphocyte populations in the context of peripheral B lymphopoiesis in humans
• Klíčová slova: B lymfocyt, periferní lymfopoéza a ontogeneze, průtoková cytometrie, imunofenotyp, evoluce adpativní imunitní odpovědi
• Klíčová slova anglicky: B lymphocyte, peripheral lymphopoiesis and ontogenesis, flow cytometry, immunophenotype,
• Akademický rok vypsání: 2014/2015
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra antropologie a genetiky člověka (31-110)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Šárka Růžičková, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem, čeká na schválení garantem
• Datum přihlášení: 11.11.2014
• Datum zadání: 02.12.2014
• Datum odevzdání elektronické podoby: 02.05.2017
• Datum proběhlé obhajoby: 05.06.2017
• Oponenti: prof. MUDr. Ondřej Hrušák, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Hlavní záměr práce je za využití vícebarevné průtokové cytometrie a diferenciačně-aktivačních povrchových znaků ve vzorcích lidských mononukleárních buněk periferní krve (PBMC) detekovat minoritní a raritní B lymfocyty dosahující frekvencí 0,01% až 0,1‰.
1) Vytvoření detailní rešerše za účelem zjištění, zda se v periferní krvi člověka mohou vyskytovat ontogenetická stádia B lymfocytů, která svými imunofenotypovými charakteristikami připomínají fylogeneticky starobylé formy těchto buněk.
2) Analýza raritních B-lymfocytů širokého spektra vývojových stádií periferní B lymfopoezy (tj. od T1 B buněk po terminální plazmatická stádia) u zdravých kontrol a u pacientů s různými imunopatologiemi, Crohnovou chorobou (včetně pacientů s biologickou léčbou) a pacientů s nádorovými chorobami.
3) Vytvoření database zahrnující cytometrická data a její udržování.
4) Identifikace imunofenotypových vzorů specifických nebo unikátních pro konkrétní typ nebo formu onemocnění pomocí pokročilejších statistických metod a grafické prezentace (např. pomocí box plotů).
Tato pilotní práce povede k detekci dosud nepopsaných B buněčných subpopulací a získání nových znalostí o jejich (pato)fyziologickém významu a obecně o složení CD19+ makropopulace B lymfocytů u člověka.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

The main goal of current study is to detect minor/rare B lymphocytes (reaching frequencies of 0,01% až 0,1‰) in samples of human peripheral blood mononuclear cells (PBMC) using polychromatic flow cytometry and differentiation and activation surface markers.
1) Using published data to perform detailed investigation whether it will be possible to detect in human preipheral blood ontogenic stages of B lymphocytes resembling by their immunophenotype characterisitcs phylogenetic ancestors of these cells.
2) Analysis of rare B lymphocytes of a wide developmental stages of peripheral B cell lymphopoiesis (i.e. from T1 B cells to terminally differentiated plasma cells) in normal healthy subjects (NHS) and patiens with various immunopathologies, Crohn disease (including those with biological therapy) and patients with tumour diseases.
3) Generation of database including flow cytometry and its maintenance.
4) Identification of immunophenotype patterns specific or unique for particular type or form of disease using advanced statistical methods and graphical presentation (such as box plots).
This pilot study will lead to detection of so far undescribed B cell subpopulations and will improve our knowledge on their (patho)physiological significance and in general on heterogenity of CD19+ macropopulation of human B lymphocytes.