Phylogenomics, genome size evolution and repeat dynamics in the genus Amomum Roxb. (Zingiberaceae)

• Název práce v češtině: Fylogenomika, evoluce genomu a dynamika repetitivních elementů v rodu Amomum Roxb. (Zingiberaceae)
• Název v anglickém jazyce: Phylogenomics, genome size evolution and repeat dynamics in the genus Amomum Roxb. (Zingiberaceae)
• Klíčová slova: NGS, Hyb-Seq, fylogenomika, biogeografie, FCM, evoluce velikosti genomu
• Klíčová slova anglicky: NGS, Hyb-Seq, phylogenomics, biogeography, FCM, genome size evolution
• Akademický rok vypsání: 2014/2015
• Typ práce: disertační práce
• Jazyk práce: angličtina
• Ústav: Katedra botaniky (31-120)
• Vedoucí / školitel: Mgr. Tomáš Fér, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 02.10.2014
• Datum zadání: 02.10.2014
• Datum odevzdání elektronické podoby: 20.01.2024
• Datum proběhlé obhajoby: 04.03.2024
• Oponenti: prof. Thomas Haevermans, Ph.D.
• Konzultanti: Mgr. Eliška Záveská, Ph.D.

Předběžná náplň práce

- morfologické a molekulární vymezení linií v rodu Amomum s.l.
- NGS sekvenování zástupců rodu Amomum s.s. a blízce bříbuzných druhů
- analýza evoluce velikosti genomu
- analýza repetitivní části genomu v evolučním kontextu

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

- morphological and molecular delineation of lineages in the genus Amomum s.l.
- NGS sequencing of representatives of the genus Amomum s.s. and closely related species
- analysis of genome size evolution
- analysis of the repetitive part of the genome in an evolutionary context