Molecular biology of soil fungi participating in litter decomposition in forest ecosystems

• Název práce v češtině: Molekulární biologie půdních hub, podílejících se na rozkladu opadu v lesních ekosystémech
• Název v anglickém jazyce: Molecular biology of soil fungi participating in litter decomposition in forest ecosystems
• Klíčová slova: ekologie mikroorganismů, dekompozice, lesní půda
• Klíčová slova anglicky: microbial ecology, decomposition, forest soil
• Akademický rok vypsání: 2013/2014
• Typ práce: rigorózní práce
• Jazyk práce: angličtina
• Ústav: Katedra genetiky a mikrobiologie (31-140)
• Řešitel: skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd.
• Datum přihlášení: 22.10.2013
• Datum zadání: 22.10.2013
• Datum potvrzení stud. oddělením: 04.11.2013
• Datum odevzdání elektronické podoby: 22.10.2013
• Datum proběhlé obhajoby: 09.12.2013

Předběžná náplň práce

Rostlinný opad je rozhodujícím zdrojem uhlíku a dalších živin v lesních půdách opadavého lesa. Zatímco mechanistický popis jeho rozkladu je dostupný, chybí informace, které by spojily průběh rozkladu se specifickými mikroorganismy - rozkladači. Mezi ně patří zejména půdní houby a bakterie. Mezi houbovými rozkladači mají specifické místo saprotrofní basidiomycety, které jsou jako jediné schopny rozkládat lignin - polyfenolický polymer, který je stavební jednotkou dřeva, ale i opadaného listí. Cílem práce je (1) charakterizovat složení společenstva hub v lesních půdách s ohledem na prostorovou heterogenitu půdy (např. vertikální stratifikace) a identifikovat faktory, rozhodující pro strukturu společenstva (sezónnost, obsah vlhkosti, pH atd.); (2) popsat sukcesi hub v průběhu rozkladu rostlinného opadu ve sledovaném ekosystému; (3) identifikovat aktivní zástupce společenstva, kteří se podílejí na rozkladu konkrétních složek opadu na základě analýzy funkčních genů, respektive jejich transkriptů a (4) charakterizovat dekompoziční schopnosti vybraných hub.