Mapping of SART3 interactions with spliceosomal snRNPs

• Název práce v češtině: Mapování interakcí SART3 se sestřihovými snRNP částicemi
• Název v anglickém jazyce: Mapping of SART3 interactions with spliceosomal snRNPs
• Klíčová slova: pre-mRNA sestřih, sestřihové snRNP částice, SART3, TPR doména
• Klíčová slova anglicky: pre-mRNA splicing, spliceosomal snRNP, SART3, TPR domain
• Akademický rok vypsání: 2013/2014
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: angličtina
• Ústav: Katedra buněčné biologie (31-151)
• Vedoucí / školitel: prof. Mgr. David Staněk, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem, čeká na schválení garantem
• Datum přihlášení: 30.10.2013
• Datum zadání: 20.11.2013
• Datum odevzdání elektronické podoby: 30.04.2015
• Datum proběhlé obhajoby: 10.06.2015
• Oponenti: Mgr. Jarmila Hnilicová, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Sestřih pre-mRNA v jádře eukaryotické buňky je zajišťován velmi dynamickým sestřihovým komplexem. Ten se skládá z množství proteinů a pěti malých jaderných ribonukleoproteinových částic (snRNP). Sestřihové snRNP se skládají postupně v několika krocích a po každém kole sestřihu se musí podobnou cestou také recyklovat. Zatím nejvíce bylo zkoumáno formování a recyklace U4/U6 a U4/U6·U5 snRNP. Zásadní roli při skládání a recyklaci U4/U6 snRNP hraje protein SART3. Naše nejnovější výsledky ukazují, že SART3 interaguje také s U5 a U2 snRNP, nicméně ani molekulární podstata ani funkce této vazby nejsou známy. Tato práce má za cíl zjistit, jakým způsobem SART3 interaguje se sestřihovými snRNP a jakou roli hraje SART3 v biogenezi a/nebo recyklaci U2 a U5 snRNP.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

In the eukaryotic cell nucleus, pre-mRNA is spliced by a dynamic complex called the spliceosome. The spliceosome contains many spliceosomal proteins and five small nuclear ribonucleoprotein particles (snRNPs). Spliceosomal snRNPs are assembled in the multi-step process and must be recycled after each round of splicing. So far, the formation and recycling of U4/U6 and U4/U6·U5 snRNPs were studied more than other snRNPs. The key role in the assembly and recycling of the U4/U6 snRNP plays the protein SART3. Our latest results show that SART3 interacts also with U5 and U2 snRNPs but neither the molecular mechanism nor the function of this binding has been revealed. The aim of this work is to elucidate how SART3 interacts with spliceosomal snRNPs and to find out the role of SART3 in U2 and U5 snRNPs biogenesis and/or recycling.