Asociace genů HSP70 s idiopatickou zánětlivou myopatií v homogenní kohortě českých pacientů

• Název práce v češtině: Asociace genů HSP70 s idiopatickou zánětlivou myopatií v homogenní kohortě českých pacientů
• Název v anglickém jazyce: Association of HSP70 genes with idiopathic inflammatory myopathy in a homogeneous cohort of Czech patients
• Akademický rok vypsání: 2012/2013
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra antropologie a genetiky člověka (31-110)
• Vedoucí / školitel: Mgr. Peter Novota, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem, čeká na schválení garantem
• Datum přihlášení: 08.08.2013
• Datum zadání: 13.08.2013
• Datum odevzdání elektronické podoby: 13.08.2013
• Datum proběhlé obhajoby: 11.09.2013
• Oponenti: RNDr. Pavlína Daňková, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Proteiny tepelného šoku (HSP70) patří do rodiny genů lokalizovaných v MHC komplexu a jsou hlavní složkou frakce proteinů tepelného šoku (HSP) exprimovaných v organizmu. Jejich exprese je indukovatelná a je iniciována v případě vystavení organizmu celulárnímu stresu nebo zranění. Mezi podněty stimulující expresi HSP70 patří také infekce nebo mechanický stres buněk. Většina proteinů rodiny HSP, včetně HSP70, plní ve své intracelulární formě roli molekulárních chaperonů, které selektivně rozpoznávají jiné proteiny a peptidy a s nimiž vytvářejí komplexy. Tvorbou komplexů účinně brání nevratným změnám proteinů, ke kterým dochází za stresových podmínek. Funkce intracelulární formy HSP70 je proto hlavně kryoprotektivní, bránící buněčné apoptóze. Molekuly HSP70 mají mimo kryoprotektivní funkce také důležitou roli v imunitní odpovědi organizmu. Díky své nezastupitelné roli v procesu prezentace antigenu na MHC molekulách I. a II. třídy, mají jejich extracelulární formy schopnost stimulovat adaptivní a přirozenou imunitní odpověď. V rámci pilotní studie byla nalezena závislost mezi mírou aktivace exprese HSP70 genů a jejich polymorfismy ve skupině zdravých kontrol. Cílem navrhované diplomové práce je prověřit tento vztah na skupině pacientů se zánětlivou idiopatickou myopatií, u kterých byla nalezena zvýšená exprese HSP70 genů jak na úrovni mRNA, tak na úrovni proteinu. Při vypracování této diplomové práce se student naučí řadu metodických postupů, jako jsou extrakce DNA a RNA, PCR, RT-PCR, kvantitativní PCR v reálném čase, sekvenační reakce, základy práce s tkáňovými kulturami a příprava mononukleárních buněk z periferní krve.