Strukturní biologie komplexu potkaních NK buněčných receptorů NKR-P1B a Clrb

• Název práce v češtině: Strukturní biologie komplexu potkaních NK buněčných receptorů NKR-P1B a Clrb
• Název v anglickém jazyce: Structural biology of complex of rat NK cell receptors NKR-P1B and Clrb
• Klíčová slova: NK buňka, receptor, NKR-P1, Clrb, HEK293, proteinová krystalografie
• Klíčová slova anglicky: NK cell, receptor, NKR-P1, Clrb, HEK293, protein crystallography
• Akademický rok vypsání: 2012/2013
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra biochemie (31-250)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Ondřej Vaněk, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 07.11.2012
• Datum zadání: 07.12.2012
• Datum odevzdání elektronické podoby: 19.05.2014
• Datum proběhlé obhajoby: 02.06.2014
• Oponenti: RNDr. Marek Ingr, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Příprava rozpustných forem dvou lektinových receptorů potkaních NK buněk, NKR-P1B a Clrb, rekombinantní expresí pomocí tranzietní transfekce buněčné linie HEK293. Příprava fúzních konstruktů těchto receptorů a následná purifikace dimerních forem těchto receptorů pomocí afinitní a HPLC chromatografie. Charakterizace komplexu biofyzikálními metodami (např. analytická ultracentrifugace, rezonance povrchového plazmonu, hmotnostní spektrometrie) a strukturní studium rClrb a jeho komplexu s NKR-P1B pomocí proteinové krystalografie.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

Preparation of soluble forms of two lectin receptors of rat NK cells, NKR-P1B and Clrb, by recombinant expression using transient transfection of HEK293 cell line. Preparation of fusion constructs of these receptors and subsequent purification of dimeric receptors by affinity and HPLC chromatography. Characterization of the protein complex by biophysical methods (e.g. analytical ultracentrifugation, surface plasmon resonance, mass spectrometry) and structural study of rClrb and its complex with NKR-P1B by protein crystallography.