Detection of positive selection in reproductive genes of songbirds

• Název práce v češtině: Detekce pozitivní selekce v reprodukčních genech pěvců
• Název v anglickém jazyce: Detection of positive selection in reproductive genes of songbirds
• Klíčová slova: evoluce, selekce, pěvci, spermie, samičí pohlavní trakt
• Klíčová slova anglicky: evolution, selection, songbirds, spermatozoa, female reproductive tract
• Akademický rok vypsání: 2020/2021
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: angličtina
• Ústav: Katedra zoologie (31-170)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Radka Reifová, Ph.D.
• Řešitel: Mgr. Lukáš Cakl - zadáno a potvrzeno stud. odd.
• Datum přihlášení: 21.12.2020
• Datum zadání: 21.12.2020
• Datum potvrzení stud. oddělením: 21.12.2020
• Datum odevzdání elektronické podoby: 12.12.2023
• Datum proběhlé obhajoby: 24.01.2024
• Oponenti: RNDr. Martin Těšický, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Cílem práce bude detekce pozitivní selekce v genomech dvou druhů slavíků, slavíka obecného a slavíka tmavého. Genomická data jsou již k dispozici. Cílem práce bude identifikace kódujících sekvencí v genomech, detekce synonymních a nesynonymních záměn mezi druhy a identifikace konkrétních genů na, které působí pozitivní selekce. Výsledky budou dané do kontextu speciace těchto dvou druhů pěvců.