Environmentální mikrobiologie - MO550P06

• Anglický název: Environmnetal microbiology
• Zajišťuje: Ústav pro životní prostředí (31-550)
• Fakulta: Přírodovědecká fakulta
• Platnost: od 2015
• Semestr: letní
• E-Kredity: 4
• Způsob provedení zkoušky: letní s.:
• Rozsah, examinace: letní s.:2/0, Zk [HT]
• Počet míst: neomezen
• Minimální obsazenost: 5
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: zrušen
• Jazyk výuky: čeština
• Vysvětlení: Přednáška bude vedena na Mikrobiologickém ústavu AVČR.
• Poznámka: povolen pro zápis po webu
• Garant: doc. RNDr. Čeněk Novotný, CSc.

Literatura

Poslední úprava: Marek Hovorka (07.04.2003)

R.M. Atlas, R. Bartha: Microbial Ecology. Benjamin

Cummings 1993.

R.M. Maier, I.L. Pepper, C.P. Gerba: Environmental

Microbiology. Academic Press 2000.

H. G. Schlegel: General Microbiology, 6th edition.

Cambridge University Press 1986.

K. Killham: Soil Ecology. Cambridge University Press 1994.

T.E. Ford (Ed.): Aquatic Microbiology: An Ecological

Approach. Blackwell Scientific Publications 1993.

R.D. Norris: Handbook of Bioremediation. Lewis Publishers

1994.

P. Pitter, J. Chudoba: Biodegradability of Organic

Substances in the Aquatic Environment. CRC Press 1990.

B.C. Alleman, A. Leeson: In Situ and On-Site Bioremediation,

Vol. 1-5. Battelle Press 1997.

K. Alef, P. Nannipieri (Eds.): Methods in Applied Soil

Microbiology and Biochemistry. Academic Press 1998.

M.J. Carlile, S.C. Watkinson, G.W. Gooday: The Fungi, 2nd

edition. Academic Press 2001.

G. Persoone, C. Janssen, W. DeCoen: New Microbiotests

for Routine Toxicity Screening and Biomonitoring. Kluwer

Academic/Plenum Publishers 2000.

D.J. Hoffman, B.A. Rattner, G.A. Burton, J. Cairns: Handbook

of Ecotoxicology. CRC Press 1995.

Sylabus

čeština

Poslední úprava: Marek Hovorka (07.04.2003)

• Jednotlivé typy mikroorganismu vyskytující se v

prírode a jejich základní charakteristiky: viry, bakterie, rasy,

houby, protozoa

• Rust a kultivace mikroorganismu, vliv

koncentrace substrátu, jednorázová a kontinuální kultivace,

aerobní a anaerobní rust, rust jednobunecných a vláknitých

mikroorganismu, základní charakteristiky látkového a

energetického metabolismu

• Mikroorganismy v pude: složení a struktura pudy,

organická hmota, pevná, kapalná a plynná fáze, složení a

distribuce mikroorganismu, role mikroorganismu:

tvorba pudy, cykly, bioremediace

• Mikroorganismy ve vodném prostredí:

sladkovodní a morské prostredí a jejich mikrobní

charakteristiky, plankton, benthos, stratifikovaná mikrobní

spolecenství,

biofilmy, extrémní prostredí: rozhraní voda-vzduch, horké

prameny, slaná jezera, morské hlubiny.

• Mikroorganismy ve vzduchu: atmosféra, typy a

šírení mikroorganismu, bioaerosoly, environmentální faktory

a prežívání mikroorganismu, bezpecnost v laboratori

• Prenos mikroorganismu v prostredí, prenos

genetické informace v prostredí, odber vzorku z prostredí a

jejich zpracování, mikroskopické vyhodnocení, kultivacní

metody, fyziologické metody, analýza DNA, imunologické

metody, indikátorové mikroorganismy

• Role mikroorganismu v biogeochemických

cyklech: uhlíkový cyklus, dusíkový cyklus, cyklus síry;

dusledky biogeochemických cyklu: koroze materiálu,

leaching

a získávání kovu, kontaminace nitráty, kompostování

• Mikroorganismy a rozklad organických

polutantu: hlavní typy polutantu a zdroje znecistení,

biodegradace, biodegradovatelnost, aerobní degradace,

anaerobní

degradace, bioremediace, typy používaných

mikroorganismu, fytoremediace

• Domácí odpad a jeho zpracování: tekutý odpad,

cistení vody, aktivovaný kal, biofiltry, speciální reaktory;

pevný odpad, úložište mestského odpadu,

kompostování, skládky prumyslového odpadu

• Biodegradace v pude: sorpce polutantu,

dostupnost polutantu pro mikrobní metabolismus,

imobilizace polutantu, hydrofobní polutanty, biosurfaktanty

• Dostupné remediacní biotechnologie: biofiltry,

COV, speciální reaktory, cistení sedimentu, cistení pudy,

metody in situ: bioventing, bioaugmentation, pridávání

živin, exogenní mikrobní preparáty, metody ex situ: biopiling,

kompostování, bioslurring, použití ligninolytických hub;

ekonomická hlediska bioremediace

• Biologická a genetická toxicita a její merení:

testy biologické toxicity - bakteriální testy, rasové testy, testy

s dafniemi, testy s rostlinami, kontaktní pudní testy;

testy genetické toxicity: Amesuv test, SOS Chromotest

• Merení ekologických rizik (risk assessment):

identifikace rizika, expozice, vztah dávky a odpovedi,

charakterizace rizika, riziko mikrobiální infekce, hodnocení

rizik spojených s bioremediací

Návaznost na jiné kurzy na PrF UK: Mikrobiologie,

Mikrobiální ekologie vody, Znecištování a ochrana vod,

Environmentální chemie, Environmentální aspekty

technologií a

težby, Základy pedologie a ochrana pudy, Hygiena,

Hydrobiologie, Odpady, Ochrana ovzduší

angličtina

Poslední úprava: Marek Hovorka (07.04.2003)

Basic types of microorganisms in the environment

Microorganisms in soil, water, air

Transport of microorganisms in the environment, sampling

Role of microorganisms in biogeochemical cycling

Pollutant decomposition by microorganisms

Waste biodecomposition

Biological water treatment

Remediation technology in water treatment

Toxicity and risk assesment in remediation technology