Úvod do molekulární paleontologie - MG422C04

• Anglický název: Introduction to molecular paleontology
• Český název: Úvod do molekulární paleontologie
• Zajišťuje: Ústav geologie a paleontologie (31-420)
• Fakulta: Přírodovědecká fakulta
• Platnost: od 2008 do 2018
• Semestr: letní
• E-Kredity: 3
• Způsob provedení zkoušky: letní s.:
• Rozsah, examinace: letní s.:0/2, Zk [HT]
• Počet míst: neomezen
• Minimální obsazenost: neomezen
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: čeština
• Poznámka: povolen pro zápis po webu
• Garant: doc. Mgr. Radka Symonová, Ph.D.
• Vyučující: doc. Mgr. Radka Symonová, Ph.D.

Anotace

Poslední úprava: Rudolf Trnka (01.04.2008)

zprostředkovat znalosti z biologie nezbytné pro pochopení základních aspektů molekulární paleontologie a principů jejího
studia

Literatura

Poslední úprava: Rudolf Trnka (01.04.2008)

Hummel S 2003 Ancient DNA Typing, Springer.

Nielsen-Marsh Ch 2002 Biomolecules in fossil remains, The Biochemist, June, pp. 12-14

Shapiro B & A Cooper 2003 Beringia as an Ice Age genetic museum. Quaternary Research, 59, 1-7

Hebsgaard MB, Phillips MJ & E Willerslev 2005 Geologically ancient DNA: fact of artifact? Trends in Microbiology, 2005, from ScienceDirect electronically

Požadavky ke zkoušce

Poslední úprava: doc. Mgr. Radka Symonová, Ph.D. (11.05.2012)

Požadavky ke zkoušce:

Vypracování návrhu projektu (3-5 stran) s event. využitím metod molekulární paleontologie ve svém vlastním zaměření (důraz je kladen na kontext, ve kterém by se uvedené metody aplikovaly, tzn. konkrétní problém řešený klasickými metodami a následně doplněn o molekulárně paleontologický přístup), včetně presentace projektu a diskuse.

Vlastní zkouška: první část písemka (ca. 10 otázek) a pak dle zvládnutí písemky ještě ústní část v podobě diskuse nad písemkou.

Sylabus

Poslední úprava: SYMONOVA/NATUR.CUNI.CZ (25.10.2011)

Studenti si během teoretické části osvojí: 1) Základní znalosti z molekulární biologie a genetiky týkající se struktury a dynamiky DNA - formou přednášek, workshopu a promítání krátkých animací z oblasti molekulární biologie a genetiky. 2) Aspekty molekulární biologie, jichž se využívá v technologiích pracujících s fosilní DNA 3) Podmínky pro uchování DNA ve fosilním záznamu, typy degradace a modifikace DNA v zavislosti na sedimentačním prostředí. 4) Diagnostika fosilií před vlastním zpracováním fosilní DNA - nepřímý odhad zachování DNA. 5) Oblasti využití molekulární paleontologie s konkrétními příklady. 6) Technologie umožňující molekulárně-paleontologický výzkum. 7) Metody práce se starou DNA a jejich specifika. 8) Evoluce genomu, paleogenomika - paleopolyploidizace a další mechanizmy: genetická exkurze do historie života, hypotesa 2R a její následky pro současnost. Teoretická/virtuální molekulární paleontologie.

V případě možnosti a zájmu bude kurz završen praktickým cvičením v laboratoři (extrakce recentní, subrecentní a fosilní DNA, srovnání výsledků), ideálně zpracování autentického materiálu, který se bude právě zpracovávat v laboratoři.

Forma výuky: 8 teoretických lekcí, zpracování samostatné práce a její vyhodnocení

Požadavky ke zkoušce:

Vypracování návrhu projektu (3-5 stran) s event. využitím metod molekulární paleontologie ve svém vlastním zaměření (důraz je kladen na kontext, ve kterém by se uvedené metody aplikovaly, tzn. konkrétní problém řešený klasickými metodami a následně doplněn o molekulárně paleontologický přístup), včetně presentace projektu a diskuse.

Vlastní zkouška: první část písemka (ca. 10 otázek) a pak dle zvládnutí písemky ještě ústní část v podobě diskuse nad písemkou.

Studenti ke každé přednášce dostávají vytištěné presentace, kt. jim slouží jako základní materiál k přípravě na zkoušku.