Mikroskopická technika - MB160C45

• Anglický název: Microscopic techniques
• Zajišťuje: Katedra parazitologie (31-161)
• Fakulta: Přírodovědecká fakulta
• Platnost: od 2008 do 2012
• Semestr: zimní
• E-Kredity: 2
• Způsob provedení zkoušky: zimní s.:
• Rozsah, examinace: zimní s.:0/2, Z [DS]
• Počet míst: neomezen
• Minimální obsazenost: neomezen
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: čeština
• Další informace: http://natur.cuni.cz/parasitology/parpages/mikroskopickatechnika/
• Poznámka: povolen pro zápis po webu
• Garant: doc. Mgr. Vladimír Hampl, Ph.D.
• Vyučující: prof. RNDr. Jana Albrechtová, Ph.D.; doc. Mgr. Vladimír Hampl, Ph.D.; RNDr. Miroslav Hyliš, Ph.D.; RNDr. Petr Jan Juračka, Ph.D.; Mgr. Zuzana Kubínová, Ph.D.; RNDr. Veronika Sacherová, Ph.D.; RNDr. Aleš Soukup, Ph.D.; Mgr. Ondřej Šebesta
• Třída: SEM s vysokým rozlišením
• Atributy: K bakal. zkoušce uč. biologie; Modul Ostatní předměty

Anotace

čeština

Cílem praktik je teoreticky i prakticky seznámit studenty se základními druhy mikroskopie - světelnou, fluorescenční a elektronovou - a jejich modifikacemi.

Praktika se budou konat ve 4 nezávislých 4 hodinových turnusech. Studenti se budou moci zapsat na turnusy podle vlastních časových možností. Jsou k dispozici zde https://docs.google.com/a/natur.cuni.cz/spreadsheet/ccc?key=0AgSjz0HANaJ1dFVIMG1ZZVFUVTc4bGVVQVU5Zmx0dnc#gid=0. Kurzy poběží od 8.10. Dotazy adresujte na Vladimíra Hampla ([e-mail]).

Poslední úprava: Hampl Vladimír, doc. Mgr., Ph.D. (20.09.2013)

angličtina

Microscopic techniques is an exercise aimed to introduce students to various types of microscopy (light microscopy, fluorescence and electron microscopy) and to practical use of these techniques on model examples (counting of micoscopic objects, digital image analysis).

The course will take place in 4 independent classes, 4 hours each. Students should enlist for the classes acording to their time possibilities. The enlistment forms are available here https://docs.google.com/a/natur.cuni.cz/spreadsheet/ccc?key=0AgSjz0HANaJ1dFVIMG1ZZVFUVTc4bGVVQVU5Zmx0dnc#gid=0. The courses will start on 10.10. Questions should be addressed to Vladimír Hampl ([e-mail]).

Poslední úprava: Hampl Vladimír, doc. Mgr., Ph.D. (20.09.2013)

Literatura

http://natur.cuni.cz/parasitology/parpages/mikroskopickatechnika/

Poslední úprava: Hampl Vladimír, doc. Mgr., Ph.D. (05.10.2013)

Požadavky ke zkoušce

Během zápočtového týdne budeme udělovat zápočty v těchto termínech:

středa 11.1. 14:00-16:00 hod.

pátek 13.1. 10:45-12:00 hod.

vždy v Parazitologické posluchárně (V7, 1. suterén). K zápočtu je nutné předložit protokoly z 1., 3. a 4. bloku cvičení. Další hromadný termín/ny ve zkouškovém oznámím později.

Poslední úprava: Hampl Vladimír, doc. Mgr., Ph.D. (24.09.2013)

Sylabus

čeština

http://natur.cuni.cz/parasitology/parpages/mikroskopickatechnika/

Praktikum je rozděleno na čtyři části:

1. Světelná mikroskopie (Hampl a kol.)

Student se seznámí s teorií týkající se světelné mikroskopie a se základy práce se světelným mikroskopem (použití imerzního oleje, zástin a fázový kontrast). Dále se seznámí s přípravou nativních a barvených preparátů (barvení Giemsa-Romanowski, opálovou modří a nativní barvení karmínem). Pozorovanými objekty jsou prvoci z různých skupin (trichomonády, trypanosomy, měňavky, nálevníci).

2. Speciální světelná a fluorescenční mikroskopie (Hampl a kol.)

Student se seznámí s teorií týkající se, Nomarskiho diferenciálního interferenčního kontrastu (DIC) a flurescence. Student si vyzkouší práci s DIC, a připraví si jednoduchý preparát pro fluorescenční mikroskopii, který si prohlédne. Součástí praktika je i malá exkurze do fakultní servisní laboratoře konfokální mikroskopie.

3. Elektronová mikroskopie (Juračka P., Sacherová V.)

Student se seznámí s teorií elektronové mikroskopie a se základními postupy při přípravě preparátů. Bude si moci vyzkoušet práci se skenovacím a transmisním elektronovým mikroskopem ve specializované laboratoři elektronové mikroskopie včetně přípravy jednoduchého preparátu.

4. Zpracování a analýza obrazu v mikroskopii (Jana Albrechtová, Aleš Soukup a kol.)

V této části se student seznámí se základy digitalizace a zpracování obrazu, prezentace obrazu a základními fázemi a operacemi analýzy obrazu. Praktická cvičení jsou prováděna v programu ImageJ (National Institutes of Health, Bethesda, Maryland, USA; URL: http://imagej.nih.gov) . Více na webových stránkách Bloku 4.

http://natur.cuni.cz/parasitology/parpages/mikroskopickatechnika/

Poslední úprava: Hampl Vladimír, doc. Mgr., Ph.D. (24.09.2013)

angličtina

1. Light microscopy (Hampl et al.)

Introduction to the basic theory of light microscopy and handling the light microscope (oil immersion, phase contrast, Nomarski differential

interference contrast). Students will prepare native and stained microscopic slides (Giemsa-Romanowski staining, opal blue and native carmin staining). The techniques will be demonstrated on protozoa with various taxonomic affiliation (trichomonads, trypanosomes, ciliates and amoebae).

2. Special light and fluorescence microsopy (Hampl et al.)

Students will be introduced into the basics of the theory of contrasts in the light microscopy (phase contrast, DIC, Hofman contrast), fluorescence and confocal microscopy. They will practically learn the work with phase contrast and fluorescence microscope including the preparation of specimens. During the course we will visit the specialised laboratory of confocal microskopy.

3. Electron microsopy (Sacherová)

Students will be introduced into the theory of electron microscopy and preparation of specimens. They will have chance to work practically with scanning and transmission electron microscope and prepare simple specimens.

4. Introduction to the image analysis (Jana Albrechtová, Aleš Soukup et al.)

In this section, students learn the basics of digitization and image processing, phases and basic operations of image analysis. Practical exercises are conducted in the program ImageJ (National Institutes of Health, Bethesda, Maryland, USA, URL: http://imagej.nih.gov). More on the website of Block 4.

http://natur.cuni.cz/parasitology/parpages/mikroskopickatechnika/

Poslední úprava: SADLOVA/NATUR.CUNI.CZ (18.06.2015)