Praktikum z molekulární fylogenetiky - MB160C21

• Anglický název: Practical course of molecular phylogenetics
• Český název: Praktikum z molekulární fylogenetiky
• Zajišťuje: Katedra parazitologie (31-161)
• Fakulta: Přírodovědecká fakulta
• Platnost: od 2024
• Semestr: zimní
• E-Kredity: 1
• Způsob provedení zkoušky: zimní s.:
• Rozsah, examinace: zimní s.:0/22, Z [HS]
• Počet míst: 20
• Minimální obsazenost: neomezen
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: angličtina
• Další informace: http://web.natur.cuni.cz/~vlada/moltax/
• Poznámka: povolen pro zápis po webu; při zápisu přednost, je-li ve stud. plánu
• Garant: doc. Mgr. Vladimír Hampl, Ph.D.
• Vyučující: doc. Mgr. Vladimír Hampl, Ph.D.

Anotace

čeština

Praktické cvičení ke kurzu B160P21 Molekulární taxonomie. Obsah: Praktické cvičení
zaměřené na seznámení posluchačů se základními programy využívanými v molekulární taxonomii a příbuzných oborech a
základními molekulárně biologickými technikami používanými v molekulární taxonomii a fylogenetice. Počet posluchačů
může být omezen. Více informací na http://web.natur.cuni.cz/~vlada/moltax/.

Poslední úprava: Hampl Vladimír, doc. Mgr., Ph.D. (02.09.2024)

angličtina

Annotation - Application of molecular biology techniques in taxonomy, epidemiology, forensic medicine, evolutionary biology, sociobiology. Basic laboratory techniques, sequencing, molecular fingerprinting, DNA hybridization, allozyme analysis, immunological techniques. Genetic distances, construction of phylogenetic trees, analysis of statistical support for the trees. See also http://web.natur.cuni.cz/~vlada/moltax/.

Poslední úprava: Hampl Vladimír, doc. Mgr., Ph.D. (02.09.2024)

Literatura

Felsenstein J: Inferring phylogenies. Sinauer Associates, Inc., USA, 2004
Hillis DM, Moritz C a Mable BK: Molecular Systematics, second edition. Sinauer Associates, Inc., USA, 1996
Avise JC. Molecular Markers, Natural History and Evolution, second edition. Sinauer Associates, Inc., USA, 2004

Poslední úprava: Hampl Vladimír, doc. Mgr., Ph.D. (02.09.2024)

Požadavky ke zkoušce

Odevzdání samostatně vyřešené úlohy.

Poslední úprava: Hampl Vladimír, doc. Mgr., Ph.D. (02.09.2024)

Sylabus

Practicals will be held in room B5 (V7) on Mondays at 13:00.

28. 11. – Database searches, sequence formats, alignment

5. 12. – Trees from the DNA sequences

12. 12. – Trees from amino acid sequences

19. 12. – Bayesian methods, molecular dating

9. 1. – Metabarcoding

Poslední úprava: Hampl Vladimír, doc. Mgr., Ph.D. (02.09.2024)