Základní praktikum z molekulární biologie - MB140C71

• Anglický název: Practical course essentials in molecular biology
• Zajišťuje: Katedra genetiky a mikrobiologie (31-140)
• Fakulta: Přírodovědecká fakulta
• Platnost: od 2010 do 2013
• Semestr: letní
• E-Kredity: 1
• Způsob provedení zkoušky: letní s.:
• Rozsah, examinace: letní s.:0/1, Z [DS]
• Rozsah za akademický rok: 1 [dny]
• Počet míst: neomezen
• Minimální obsazenost: neomezen
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: čeština
• Úroveň: základní
• Vysvětlení: jednodenní turnusové prakrtikum
• Poznámka: povolen pro zápis po webu
• Garant: RNDr. Martin Pospíšek, Ph.D.
• Vyučující: RNDr. Tomáš Mašek, Ph.D.; RNDr. Martin Pospíšek, Ph.D.; Mgr. Václav Vopálenský, Ph.D.
• Třída: Ultracentrifuga a 3 rotory; Gradientový PCR cycler
• Atributy: Modul Buněčná a molekulární biologie

Anotace

Cvičení sestává z teoretické, demonstrační a praktické části. Před cvičením je doporučeno absolvovat alespoň jednu z následujících přednášek: Základy molekulární biologie, Molekulární biologie, Biologie buňky, Biochemie, Genetika ale není to podmínkou.

Poslední úprava: RNA_CLUB/NATUR.CUNI.CZ (13.01.2011)

Literatura

K tomuto praktiku není doporučená literatura. Studenti obdrží protokoly s dalšími informacemi v průběhu praktika.

Poslední úprava: Pospíšek Martin, RNDr., Ph.D. (05.04.2012)

Požadavky ke zkoušce

Studenti ukončí praktikum vypracováním protokolů a složením zápočtového testu. Více informací, texty, protokoly a presentace jsou pro studenty zapsané do kurzu k dispozici na http://web.natur.cuni.cz/~pospisek

Poslední úprava: Pospíšek Martin, RNDr., Ph.D. (05.04.2012)

Sylabus

1) V teoretické části budou stručně diskutovány základní techniky genového inženýrství s důrazem na ty, které budou použity v praktické části:

PCR, sekvenování, analytická elektroforetická separace proteinů a nukleových kyselin, DNA vektory, genomové a cDNA knihovny. Základní mol. biol. databáze - práce s NCBI-NIH atd. Krátce i využití těchto metod a databází v lékařské, soudní a biotechnologické praxi. Před detailním popisem metod bude dávána přednost jejich aktualizaci v souladu se současnými znalostmi publikovanými v odborných i laických médiích širokého dosahu. Předpokládá se možnost aktuálních změn v reakci na dotazy a potřeby zúčastněných studentů.

2) V demonstrační části budou ukazovány některé náročnější metody diskutované v teoretické části dle aktuálních možností.

3) V praktické části si každý student vyzkouší některou z metod purifikace DNA, mapování DNA restrikčními endonuklázami, polymerasovou řetězovou reakci (PCR), detekci nukleových kyselin pomocí agarosové elektroforézy, transformaci bakterií rekombinantním DNA vektorem a výpočet transformační účinnosti, pozorování exprese cizorodých bílkovin v kultuře E.coli (proteinová elektroforéza, sledování fluorescence zeleného fluorescenčního proteinu in vivo).

Studenti si vyzkouší volně dostupné počítačové programy pro navrhování DNA primerů pro PCR a programy pro klonování in silico a další teoretické úlohy s využitím veřejných mol.biol. databází.

Studenti ukončí praktikum vypracováním protokolů a složením zápočtového testu. Více informací, texty, protokoly a presentace jsou pro studenty zapsané do kurzu k dispozici na http://web.natur.cuni.cz/~pospisek

Poslední úprava: Vopálenský Václav, Mgr., Ph.D. (24.08.2017)