Ramanova mikrospektroskopie kapkově nanášených povlaků (DCDR) cukrů

• Název práce v češtině: Ramanova mikrospektroskopie kapkově nanášených povlaků (DCDR) cukrů
• Název v anglickém jazyce: Drop coating deposition Raman microspectroscopy (DCDR) of carbohydrates
• Klíčová slova: DCDR|Ramanova spektroskopie|cukry
• Klíčová slova anglicky: DCDR|Raman spectroscopy|carbohydrates
• Akademický rok vypsání: 2019/2020
• Typ práce: bakalářská práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Fyzikální ústav UK (32-FUUK)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Vladimír Kopecký, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd.
• Datum přihlášení: 24.11.2019
• Datum zadání: 26.11.2019
• Datum potvrzení stud. oddělením: 13.12.2019
• Datum a čas obhajoby: 03.02.2022 09:00
• Datum odevzdání elektronické podoby: 06.01.2022
• Datum odevzdání tištěné podoby: 06.01.2022
• Datum proběhlé obhajoby: 03.02.2022
• Oponenti: RNDr. Eva Kočišová, Ph.D.
• Konzultanti: RNDr. Kateřina Hofbauerová, Ph.D.

Zásady pro vypracování

1. Seznámit se s principy Ramanovy mikroskopie a Ramanovy spektroskopie kapkově nanášených povlaků (drop coating deposition Raman spectroscopy - DCDR).
2. Vypracovat rešerši na téma studium biomolekul pomocí DCDR a studium cukrů pomocí Ramanovy a obecněji vibrační spektroskopie (se zvláštním zřetelem na cukry přítomné v glykoproteinech).
3. Prakticky zvládnout měření na Ramanově mikrospektrometru.
4. Změřit DCDR spektra vybrané série cukrů (se zvláštním důrazem na cukry přítomné v glykoproteinech).
5. Provést analýzu dat se zaměření na reprodukovatelnost DCDR měření a vztah Ramanova spektra vs. struktura cukru.

Seznam odborné literatury

M. F. Mrozek, D. Zhang, D. Ben-Amotz: Oligosaccharide identification and mixtue quantification using Raman spectroscopy and chemometric analysis. Carbohydrate Research 339 (2004) 141-145.
D. Zhang, Y. Xie, M. F. Mrozek, C. Ortiz, V. J. Davisson, D. Ben-Amotz: Raman detection of proteomic analytes. Analytical Chemistry 75 (2003) 5703-5709.
M. E. Taylor, K. Drickamer: Introduction to glycobiology. Oxford University Press, Oxford - New York 2003, 2006.

Předběžná náplň práce

Ramanova spektroskopie kapkově nanášených povlaků (drop coating deposition Raman spectroscopy - DCDR) je novou, pouze několik let starou techniku měření biomolekul, jež je založena na interakci molekul a speciálně k tomu připraveného hydrofobního povrchu. Měření tak lze provádět za až o dva řády nižších koncentrací biomolekul než je tomu obvyklé u standardní Ramanovy spektroskopie. Náplní bakalářské práce by mělo být otestování použitelnosti DCDR techniky pro měření vzorků cukrů a vytvoření referenční databáze DCDR spekter pro účely studia glykoproteinů. Měření budou prováděna na novém Ramanově mikrospektrometru LabRam HR800 (Horiba Jobin Yvon), tj. na Ramanově spektrometru kombinovaném s mikroskopem.