Zpožděná fluorescence pro detekci singletního kyslíku

• Název práce v češtině: Zpožděná fluorescence pro detekci singletního kyslíku
• Název v anglickém jazyce: Delayed Fluorescence for Singlet Oxygen Detection
• Klíčová slova: zpožděná fluorescence|singletní kyslík|časově rozlišená spektroskopie|fotodynamická terapie
• Klíčová slova anglicky: delayed fluorescence|singlet oxygen|time-resolved spectroscopy|photodynamic therapy
• Akademický rok vypsání: 2024/2025
• Typ práce: disertační práce
• Ústav: Katedra chemické fyziky a optiky (32-KCHFO)
• Vedoucí / školitel: doc. RNDr. Roman Dědic, Ph.D.

Zásady pro vypracování

1. seznámení se s principem PDT a fotodynamické inaktivace
2. základní seznámení se s obsluhou luminiscenčního mikroskopu
3. seznámení se s činností hradlovaného fotonásobiče a zesilované kamery
4. seznámení se s přípravou a vlastnostmi fotosensibilizujících nanomateriálů
5. rešerše dosud publikovaných výsledků
6. studium zpožděné fluorescence a interakce fotosensibilizátorů s buněčným prostředím pomocí luminiscenčního mikroskopu
7. měření zpožděné fluorescence fotosensibilizátorů a fosforescence singletního kyslíku pomocí aparatury pro sběr s povrchu makroskopických biologických vzorků

Seznam odborné literatury

[1] GOMER, C. J. (Ed.). Photodynamic Therapy: Methods and Protocols. 635 / Methods in Molecular Biology. New York, USA : Humana Press, 2010.
[2] SCHOLZ, M. and DĚDIC, R. Singlet oxygen-sensitized delayed fluorescence. Ch. 28 in NONELL, S. and FLORS, C. (Eds.) Singlet Oxygen: Applications in Biosciences and Nanosciences, Royal Society of Chemistry, 2016, 14, 63-81
[3] SCHOLZ, M., et al. Singlet oxygen-sensitized delayed fluorescence of common water-soluble photosensitizers, Photochemical & Photobiological Sciences 12, 2013, 1873-1884.
[4] SCHOLZ, M. et al. The singlet-oxygen-sensitized delayed fluorescence in mammalian cells: a time-resolved microscopy approach.Photochemical & Photobiological Sciences 14, 2015, 700-713.
[5] SCHOLZ, M. et al. Microscopic time-resolved imaging of singlet oxygen by delayed fluorescence in living cells, Photochemical & Photobiological Sciences, 2017.
[6] HENKE, P. Fotoaktivní polystyrenové nanomateriály produkující singletový kyslík, Disertační práce, PřF UK 2017.

Předběžná náplň práce

Fotodynamická terapie je účinnou možností léčby řady chronických a onkologických onemocnění. Fotodynamická inaktivace je novou metodou boje proti mikrobiálním onemocněním zvláště proti patogenům imunním vůči antibiotické/antimykotické léčbě. V obou těchto metodách hraje podstatnou roli vysoce reaktivní singletní excitovaný stav kyslíku, který vzniká přenosem excitační energie ze světlem vzbuzené molekuly léčiva, tzv. fotosensibilizátoru. Pro pochopení detailního mechanismu účinku a další zlepšování těchto terapeutických metod je potřebné sledovat tvorbu a chování singletního kyslíku přímo v biologických a modelových sytémech. To je možné přímo pomocí měření kinetik infračervené luminiscence singletního kyslíku. Tento signál je ale velmi slabý a jeho detekce je technicky velice náročná. Oproti tomu je možné získat informaci o kinetikách singletního kyslíku ze singletním kyslíkem sensitizované zpožděné fluorescence fotosensibilizátoru, která je řádově silnější a leží ve viditelné části spektra, proto se mnohem lépe detekuje. To umožňuje i mikroskopické zobrazování singletního kyslíku v organelách živých buňek. Školicí pracoviště patří mezi světovou špičku v oboru detekce singletního kyslíku s mnohaletou zkušeností.

Student se bude věnovat studiu chování singletního kyslíku v modelových systémech, buněčných kulturách a tkáňových modelech pomocí měření časově a prostorově rozlišené zpožděné fluorescence fotosensibilizátorů. Experimetny budou prováděn jak na mikroskopické úrovni pomocí fluorescenčního mikroskopu, tak pomocí nově vyvíjené aparatury pro simultánní detekci luminiscence singletního kyslíku a zpožděné fluorescence fotosensibilizátorů z makroskopických vzorků. Budou zkoumány různé fotosensibilizátory, včetně moderních nanočásticových nosičů fotosensibilizátorů.

Předpokládané znalosti uchazeče na úrovni ukončeného magisterského studia v oboru biofyzika a chemická fyzika.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

Photodynamic therapy is an effective treatment modality for many chronic and oncological diseases. Photodynamic inactivation is a new method of combating microbial diseases especially against pathogens immune to antibiotic/antimycothic treatment. In both of these methods, the highly reactive singlet excited state of oxygen, which results from the transfer of excitation energy from a light-excited drug molecule, the so-called photosensitizer, plays an essential role. To understand the details of mechanism of action and further improve these therapeutic methods, it is necessary to monitor the formation and behavior of singlet oxygen directly in biological and model systems. This is possible directly by measuring the kinetics of infrared luminescence of singlet oxygen. However, the signal is very weak and its detection is technically very demanding. On the other hand, it is possible to obtain information on singlet oxygen kinetics from the singlet oxygen-sensitized delayed fluorescence of the photosensitizers, which is order of magnitude stronger and lies in the visible part of the spectrum, therefore it is much easier to detect. This also allows the microscopic imaging of singlet oxygen in the organelles of living cells.

The student will study the behavior of singlet oxygen in model systems, cell cultures, and tissue models by measuring the temporally and spatially resolved delayed fluorescence of photosensitizers. Experiments will be carried out at the microscopic level using a fluorescence microscope as well as a newly developed apparatus for simultaneous detection of singlet oxygen luminescence and delayed fluorescence of photosensitizers from macroscopic samples. Various photosensitizers will be investigated, including modern nanoparticle photosensitizer carriers.

The expected knowledge of the candidate at the level of the completed master's degree in biophysics and chemical physics.