Komplexy miRNA s cílovou RNA sekvencí
Název práce v češtině: | Komplexy miRNA s cílovou RNA sekvencí |
---|---|
Název v anglickém jazyce: | miRNA complexes with the target RNA sequence |
Klíčová slova: | RNA, miRNA, Ramanova spektroskopie, UV absorpce, tání nukleových kyselin |
Klíčová slova anglicky: | RNA, miRNA, Raman spectroscopy, UV absorption, melting of nucleic acids |
Akademický rok vypsání: | 2016/2017 |
Typ práce: | diplomová práce |
Jazyk práce: | čeština |
Ústav: | Fyzikální ústav UK (32-FUUK) |
Vedoucí / školitel: | prof. RNDr. Josef Štěpánek, CSc. |
Řešitel: | skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd. |
Datum přihlášení: | 04.11.2016 |
Datum zadání: | 04.11.2016 |
Datum potvrzení stud. oddělením: | 10.01.2017 |
Datum a čas obhajoby: | 18.09.2018 09:00 |
Datum odevzdání elektronické podoby: | 20.07.2018 |
Datum odevzdání tištěné podoby: | 20.07.2018 |
Datum proběhlé obhajoby: | 18.09.2018 |
Oponenti: | Mgr. Václav Římal, Ph.D. |
Konzultanti: | RNDr. Kateřina Hofbauerová, Ph.D. |
RNDr. Jakub Klener, Ph.D. | |
Zásady pro vypracování |
1. Osvojit si techniky měření UV absorpce a Ramanova roptylu zředěných roztoků biomolekul.
2. Seznámit se se současnými výsledky studia interakce miRNA s cílovou sekvencí LCS1 a s jejími strukturními modely za různých podmínek pomocí metody SPR. 3. Navrhnout sérii RNA oligonukleotidů pro spektroskopická měření a podílet se na zajišťování a přípravě vzorků. 4. Navrhnout a realizovat sadu měření spekter Ramanova rozptylu a UV absorpce směsí interagujících RNA oligonukleotidů v závislosti na teplotě a koncentraci jednomocných nebo dvojmocných kationtů. 5. Zpracovat výsledky měření a provést jejich detailní analýzu se záměrem objasnění specifické funkce vícemocných iontů při stabilizaci komplexů miRNA s cílovým segmentem mRNA. |
Seznam odborné literatury |
W. Saenger, Principles of nucleic acid structure, Springer, Berlin 1988
V.Prosser a kol., Experimentální metody biofyziky, Academia, Praha 1989 (vybrané cásti) E.R.Malinowski, Factor analysis in chemistry, Wiley-Interscience, New York 2002 Vybraný soubor původních vědeckých prací. |