velikost textu

Nové väzobné proteíny cielené na marker epitelových buniek

Upozornění: Informace získané z popisných dat či souborů uložených v Repozitáři závěrečných prací nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora.
Název:
Nové väzobné proteíny cielené na marker epitelových buniek
Název v češtině:
Nové vazebné proteiny cílené na marker epiteliálních buněk
Název v angličtině:
Novel protein binders targeting marker of epithelial cells
Typ:
Diplomová práce
Autor:
Maroš Huličiak
Vedoucí:
RNDr. Petr Malý, CSc.
Oponent:
RNDr. Ladislav Anděra, CSc.
Id práce:
197581
Fakulta:
Přírodovědecká fakulta (PřF)
Pracoviště:
Katedra buněčné biologie (31-151)
Program studia:
Biologie (N1501)
Obor studia:
Buněčná a vývojová biologie (NBUNVYB)
Přidělovaný titul:
Mgr.
Datum obhajoby:
28. 5. 2019
Výsledek obhajoby:
Neprospěl/a
Jazyk práce:
Slovenština
Klíčová slova:
epitelová bunka, EpCAM, väzobný proteín, ribozomálny displej, kombinatoriálna knižnica, proteínový scaffold
Klíčová slova v angličtině:
epithelial cell, EpCAM, protein binder, ribosome display, combinatorial library, protein scaffold
Abstrakt:
ABSTRAKT Presná a rýchla kvantifikácia krvných cirkulujúcich nádorových buniek (CTC) u adenokarcinómu pľúc je zásadným krokom ku zrýchleniu diagnostiky, voľbe vhodnej a včasnej terapie a k určeniu prognózy liečby. Vývoj nového typu mikrofluidného zariadenia založeného na detekcii a kvantifikácii epitelových a mezenchýmových CTC buniek prietokovým čipom pomocou selektívnych vysoko afinných kotviacich proteínov je inovatívnym riešením. Témou diplomovej práce bolo vytvoriť nové typy väzobných proteínov s vysokou väzobnou afinitou a selektivitou pre membránový glykoproteín EpCAM ako zvolený marker epitelových buniek. K identifikácii týchto väzobných proteínov bola využitá metóda riadenej evolúcie proteínov, a to použitím vysoko komplexných kombinatoriálnych knižníc odvodených od štruktúry albumín-väzobnej domény (ABD) alebo „scaffoldu Myomedinu“ odvodeného od domény ľudského svalového proteínu. Výsledkom diplomovej práce je vyvinutie unikátnej zbierky vysoko afinných proteínov cielených proti rekombinantnému EpCAM a ich následná sekvenčná, biochemická a funkčná charakterizácia. Vybrané varianty proteínov môžu byť riešením pre selektujúce terčové proteíny imobilizované k povrchu mikrofluidného čipu. Kľúčové slová: epitelová bunka, EpCAM, väzobný proteín, ribozomálny displej, kombinatoriálna knižnica, proteínový scaffold
Abstract v angličtině:
ABSTRACT Fast and precise quantification of circulating tumour cells (CTC) in lung adenocarcinoma is a pivotal step in acceleration of diagnosis, selection of early therapy and estimation of treatment prognosis. Development of a new type of microfluidic device based on detection and quantification of epithelial- and mesenchymal-type CTC by high-affinity and cell-type specific protein binders anchored to a microfluidic chip surface represents a highly innovative approach. In this work, we used EpCAM membrane glycoprotein as a target for generation of epithelial cell-specific protein binders by a directed evolution of proteins selected from highly complex combinatorial libraries derived from albumin-binding domain scaffold (ABD) or human muscle protein domain-derived „Myomedin“ scaffold. Collections of EpCAM-binding candidates from the both used libraries were generated and particular binding variants were further characterized by DNA sequencing, biochemically and by functional cell-surface binding assays. The best candidates might serve as robust anchor proteins of a microfludic chip. Key words: epithelial cell, EpCAM, protein binder, ribosome display, combinatorial library, protein scaffold
Dokumenty
Stáhnout Dokument Autor Typ Velikost
Stáhnout Text práce Maroš Huličiak 3.35 MB
Stáhnout Abstrakt v českém jazyce Maroš Huličiak 347 kB
Stáhnout Abstrakt anglicky Maroš Huličiak 261 kB
Stáhnout Posudek vedoucího RNDr. Petr Malý, CSc. 858 kB
Stáhnout Posudek oponenta RNDr. Ladislav Anděra, CSc. 304 kB
Stáhnout Záznam o průběhu obhajoby doc. RNDr. Petr Folk, CSc. 154 kB