velikost textu

Phylogenetic and taxonomic characterization of new haloarchaea related to natronomonas.

Upozornění: Informace získané z popisných dat či souborů uložených v Repozitáři závěrečných prací nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora.
Název:
Phylogenetic and taxonomic characterization of new haloarchaea related to natronomonas.
Název v češtině:
Fylogenetická a taxonomická charakterizace nových haloarcheí blízkých rodu natronomonas.
Typ:
Diplomová práce
Autor:
Mgr. Anna Šantorová
Vedoucí:
Doc. PharmDr. Miloslav Hronek, Ph.D.
Oponent:
PharmDr. Petr Jílek, CSc.
Id práce:
184673
Fakulta:
Farmaceutická fakulta v Hradci Králové (FaF)
Pracoviště:
Katedra biologických a lékařských věd (16-16150)
Program studia:
Farmacie (M5206)
Obor studia:
Farmacie (FAR)
Přidělovaný titul:
Mgr.
Datum obhajoby:
29. 5. 2018
Výsledek obhajoby:
Výborně
Jazyk práce:
Angličtina
Klíčová slova:
haloarchea, taxonomie, natronomonas
Klíčová slova v angličtině:
haloarchea, taxonomy, natronomonas
Abstrakt:
ABSTRAKT Kandidát: Anna Šantorová Název diplomové práce: Fylogenetická a taxonomická charakterizace nových haloarcheí blízkých rodu Natronomonas. Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biologických a lékařských věd University of Sevilla, Faculty of Pharmacy Department of Microbiology and Parasitology Studijní program: Farmacie Tato práce pokračuje v charakterizaci nových Archeí blízkých rodu Natronomonas izolovaných z hypersalinních vod solných polí, lokalizovaných u města Huelva v jihozápadním Španělsku. Jedná se o mikroorganismy vyžadující k životu vysokou koncentraci solí v okolním prostředí. S jejich charakterizací začala Ana Durán-Viseras a během svého pobytu jsem se podílela na jejím pokračování. Pro doplnění fylogenetické studie jsme amplifikovali gen rpoB‘ jednotlivých Archeí v rámci MLSA a vytvořili fylogenetický strom. Na základě těchto výsledků jsme usoudili, že se jedná o nový rod. Tento fakt byl dále potvrzen analýzou složení polárních lipidů pomocí HPTLC. U izolované DNA jsme určili obsah guaninových a cytosinových bazí, jenž je součástí taxonomických charakterizací nových druhů. Započali jsme s fenotypickou charakterizací.
Abstract v angličtině:
ABSTRACT Candidate: Anna Šantorová Title of diploma thesis: Phylogenetic and taxonomic characterization of new haloarchaea related to Natronomonas. Charles University, Faculty of Pharmacy Department of Biological and Medicinal Sciences University of Sevilla, Faculty of Pharmacy Department of Microbiology and Parasitology Study program: Pharmacy This work continues with the characterization of new Archaea related to the genus Natronomonas isolated from hypersaline waters of solar salterns located near the city of Huelva in the southwest of Spain. These microorganisms need a high concentration of salts in the environment for their survival and growth. Ana Durán-Viseras started with their characterization and I was participating on the continuation of the project during my stay in Sevilla. To complete the phylogenetic studies, we amplified the rpoB’ gene of the potentially new species of Archaea as a part of MLSA and we created a phylogenetic tree. Based on these results we came to the conclusion that they represent new genus, which was later confirmed by the analysis of polar lipids profile by the HPTLC method. We have determined the guanine and cytosine content, which is part of the taxonomic characterization of new prokaryotic species. We have started the phenotypic characterization.
Dokumenty
Stáhnout Dokument Autor Typ Velikost
Stáhnout Text práce Mgr. Anna Šantorová 1.48 MB
Stáhnout Abstrakt v českém jazyce Mgr. Anna Šantorová 115 kB
Stáhnout Abstrakt anglicky Mgr. Anna Šantorová 114 kB
Stáhnout Posudek vedoucího Doc. PharmDr. Miloslav Hronek, Ph.D. 305 kB
Stáhnout Posudek oponenta PharmDr. Petr Jílek, CSc. 280 kB
Stáhnout Záznam o průběhu obhajoby Doc. PharmDr. Miloslav Hronek, Ph.D. 153 kB